Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ldb3Q9JKS4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ldb3Q9JKS4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ldb3Q9JKS4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ldb3Q9JKS4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ldb3Q9JKS4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ldb3Q9JKS4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ldb3Q9JKS4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ldb3Q9JKS4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ldb3Q9JKS4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ldb3Q9JKS4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ldb3Q9JKS4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ldb3Q9JKS4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ldb3Q9JKS4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ldb3Q9JKS4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ldb3Q9JKS4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ldb3Q9JKS4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ldb3Q9JKS4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ldb3Q9JKS4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ldb3Q9JKS4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ldb3Q9JKS4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ldb3Q9JKS4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ldb3Q9JKS4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ldb3Q9JKS4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ldb3Q9JKS4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ldb3Q9JKS4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ldb3Q9JKS4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ldb3Q9JKS4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ldb3Q9JKS4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ldb3Q9JKS4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ldb3Q9JKS4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ldb3Q9JKS4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ldb3Q9JKS4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ldb3Q9JKS4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ldb3Q9JKS4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ldb3Q9JKS4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ldb3Q9JKS4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ldb3Q9JKS4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ldb3Q9JKS4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ldb3Q9JKS4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ldb3Q9JKS4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ldb3Q9JKS4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ldb3Q9JKS4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ldb3Q9JKS4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ldb3Q9JKS4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ldb3Q9JKS4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ldb3Q9JKS4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ldb3Q9JKS4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ldb3Q9JKS4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ldb3Q9JKS4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ldb3Q9JKS4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms