Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyp39a1Q9JKJ9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp39a1Q9JKJ9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp39a1Q9JKJ9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cyp39a1Q9JKJ9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyp39a1Q9JKJ9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cyp39a1Q9JKJ9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp39a1Q9JKJ9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp39a1Q9JKJ9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cyp39a1Q9JKJ9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp39a1Q9JKJ9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp39a1Q9JKJ9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp39a1Q9JKJ9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cyp39a1Q9JKJ9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms