Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mrpl39Q9JKF7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mrpl39Q9JKF7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mrpl39Q9JKF7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mrpl39Q9JKF7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mrpl39Q9JKF7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mrpl39Q9JKF7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mrpl39Q9JKF7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mrpl39Q9JKF7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mrpl39Q9JKF7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mrpl39Q9JKF7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mrpl39Q9JKF7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mrpl39Q9JKF7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mrpl39Q9JKF7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mrpl39Q9JKF7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mrpl39Q9JKF7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mrpl39Q9JKF7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mrpl39Q9JKF7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mrpl39Q9JKF7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mrpl39Q9JKF7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mrpl39Q9JKF7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mrpl39Q9JKF7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mrpl39Q9JKF7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mrpl39Q9JKF7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mrpl39Q9JKF7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mrpl39Q9JKF7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mrpl39Q9JKF7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mrpl39Q9JKF7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mrpl39Q9JKF7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Mrpl39Q9JKF7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mrpl39Q9JKF7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mrpl39Q9JKF7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mrpl39Q9JKF7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mrpl39Q9JKF7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mrpl39Q9JKF7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mrpl39Q9JKF7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mrpl39Q9JKF7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mrpl39Q9JKF7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mrpl39Q9JKF7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mrpl39Q9JKF7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mrpl39Q9JKF7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mrpl39Q9JKF7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Mrpl39Q9JKF7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mrpl39Q9JKF7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mrpl39Q9JKF7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mrpl39Q9JKF7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mrpl39Q9JKF7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms