Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK97

Kcnq4, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnq4Q9JK97 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcnq4Q9JK97 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kcnq4Q9JK97 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcnq4Q9JK97 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcnq4Q9JK97 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcnq4Q9JK97 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kcnq4Q9JK97 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnq4Q9JK97 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnq4Q9JK97 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnq4Q9JK97 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnq4Q9JK97 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnq4Q9JK97 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnq4Q9JK97 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnq4Q9JK97 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kcnq4Q9JK97 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcnq4Q9JK97 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcnq4Q9JK97 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kcnq4Q9JK97 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnq4Q9JK97 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnq4Q9JK97 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnq4Q9JK97 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnq4Q9JK97 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnq4Q9JK97 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kcnq4Q9JK97 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Kcnq4Q9JK97 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnq4Q9JK97 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnq4Q9JK97 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnq4Q9JK97 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnq4Q9JK97 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnq4Q9JK97 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnq4Q9JK97 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kcnq4Q9JK97 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kcnq4Q9JK97 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnq4Q9JK97 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnq4Q9JK97 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnq4Q9JK97 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnq4Q9JK97 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kcnq4Q9JK97 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnq4Q9JK97 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnq4Q9JK97 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnq4Q9JK97 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnq4Q9JK97 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnq4Q9JK97 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kcnq4Q9JK97 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnq4Q9JK97 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnq4Q9JK97 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnq4Q9JK97 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kcnq4Q9JK97 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcnq4Q9JK97 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcnq4Q9JK97 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcnq4Q9JK97 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcnq4Q9JK97 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcnq4Q9JK97 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kcnq4Q9JK97 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcnq4Q9JK97 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kcnq4Q9JK97 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnq4Q9JK97 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnq4Q9JK97 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnq4Q9JK97 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnq4Q9JK97 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnq4Q9JK97 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnq4Q9JK97 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnq4Q9JK97 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kcnq4Q9JK97 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnq4Q9JK97 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnq4Q9JK97 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnq4Q9JK97 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnq4Q9JK97 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnq4Q9JK97 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnq4Q9JK97 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kcnq4Q9JK97 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnq4Q9JK97 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnq4Q9JK97 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnq4Q9JK97 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnq4Q9JK97 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnq4Q9JK97 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnq4Q9JK97 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnq4Q9JK97 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kcnq4Q9JK97 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnq4Q9JK97 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnq4Q9JK97 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnq4Q9JK97 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnq4Q9JK97 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Kcnq4Q9JK97 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnq4Q9JK97 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnq4Q9JK97 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnq4Q9JK97 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnq4Q9JK97 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kcnq4Q9JK97 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kcnq4Q9JK97 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kcnq4Q9JK97 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kcnq4Q9JK97 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcnq4Q9JK97 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcnq4Q9JK97 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kcnq4Q9JK97 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcnq4Q9JK97 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcnq4Q9JK97 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcnq4Q9JK97 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcnq4Q9JK97 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Kcnq4Q9JK97 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms