Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN5

Cpn1, Carboxypeptidase N catalytic chain, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpn1Q9JJN5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpn1Q9JJN5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cpn1Q9JJN5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpn1Q9JJN5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpn1Q9JJN5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpn1Q9JJN5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpn1Q9JJN5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpn1Q9JJN5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cpn1Q9JJN5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpn1Q9JJN5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cpn1Q9JJN5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpn1Q9JJN5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpn1Q9JJN5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpn1Q9JJN5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpn1Q9JJN5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpn1Q9JJN5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cpn1Q9JJN5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpn1Q9JJN5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpn1Q9JJN5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpn1Q9JJN5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpn1Q9JJN5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpn1Q9JJN5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cpn1Q9JJN5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cpn1Q9JJN5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cpn1Q9JJN5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cpn1Q9JJN5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpn1Q9JJN5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpn1Q9JJN5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpn1Q9JJN5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cpn1Q9JJN5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpn1Q9JJN5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpn1Q9JJN5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpn1Q9JJN5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpn1Q9JJN5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpn1Q9JJN5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpn1Q9JJN5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cpn1Q9JJN5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpn1Q9JJN5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpn1Q9JJN5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpn1Q9JJN5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpn1Q9JJN5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpn1Q9JJN5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cpn1Q9JJN5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpn1Q9JJN5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpn1Q9JJN5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpn1Q9JJN5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpn1Q9JJN5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpn1Q9JJN5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cpn1Q9JJN5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpn1Q9JJN5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpn1Q9JJN5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpn1Q9JJN5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpn1Q9JJN5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpn1Q9JJN5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpn1Q9JJN5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpn1Q9JJN5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpn1Q9JJN5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpn1Q9JJN5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpn1Q9JJN5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpn1Q9JJN5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cpn1Q9JJN5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpn1Q9JJN5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpn1Q9JJN5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpn1Q9JJN5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpn1Q9JJN5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpn1Q9JJN5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpn1Q9JJN5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpn1Q9JJN5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cpn1Q9JJN5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cpn1Q9JJN5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cpn1Q9JJN5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpn1Q9JJN5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cpn1Q9JJN5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cpn1Q9JJN5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cpn1Q9JJN5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpn1Q9JJN5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cpn1Q9JJN5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpn1Q9JJN5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpn1Q9JJN5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpn1Q9JJN5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpn1Q9JJN5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cpn1Q9JJN5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpn1Q9JJN5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cpn1Q9JJN5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpn1Q9JJN5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpn1Q9JJN5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpn1Q9JJN5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpn1Q9JJN5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpn1Q9JJN5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpn1Q9JJN5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpn1Q9JJN5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpn1Q9JJN5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpn1Q9JJN5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpn1Q9JJN5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpn1Q9JJN5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpn1Q9JJN5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpn1Q9JJN5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cpn1Q9JJN5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpn1Q9JJN5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cpn1Q9JJN5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms