Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smad9Q9JIW5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smad9Q9JIW5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smad9Q9JIW5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smad9Q9JIW5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smad9Q9JIW5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smad9Q9JIW5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smad9Q9JIW5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smad9Q9JIW5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smad9Q9JIW5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smad9Q9JIW5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smad9Q9JIW5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smad9Q9JIW5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smad9Q9JIW5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smad9Q9JIW5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smad9Q9JIW5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smad9Q9JIW5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smad9Q9JIW5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smad9Q9JIW5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smad9Q9JIW5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smad9Q9JIW5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smad9Q9JIW5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smad9Q9JIW5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smad9Q9JIW5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms