Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI74

Klhl1, Kelch-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl1Q9JI74 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl1Q9JI74 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl1Q9JI74 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl1Q9JI74 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl1Q9JI74 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl1Q9JI74 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl1Q9JI74 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl1Q9JI74 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl1Q9JI74 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl1Q9JI74 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl1Q9JI74 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl1Q9JI74 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl1Q9JI74 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl1Q9JI74 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl1Q9JI74 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Klhl1Q9JI74 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Klhl1Q9JI74 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl1Q9JI74 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl1Q9JI74 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl1Q9JI74 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl1Q9JI74 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl1Q9JI74 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl1Q9JI74 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl1Q9JI74 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl1Q9JI74 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl1Q9JI74 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl1Q9JI74 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl1Q9JI74 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl1Q9JI74 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl1Q9JI74 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl1Q9JI74 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl1Q9JI74 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl1Q9JI74 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl1Q9JI74 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl1Q9JI74 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl1Q9JI74 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl1Q9JI74 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl1Q9JI74 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl1Q9JI74 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl1Q9JI74 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl1Q9JI74 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl1Q9JI74 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl1Q9JI74 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl1Q9JI74 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl1Q9JI74 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl1Q9JI74 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl1Q9JI74 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl1Q9JI74 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl1Q9JI74 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl1Q9JI74 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl1Q9JI74 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl1Q9JI74 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klhl1Q9JI74 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl1Q9JI74 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl1Q9JI74 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl1Q9JI74 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl1Q9JI74 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Klhl1Q9JI74 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klhl1Q9JI74 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Klhl1Q9JI74 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klhl1Q9JI74 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klhl1Q9JI74 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Klhl1Q9JI74 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl1Q9JI74 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl1Q9JI74 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl1Q9JI74 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl1Q9JI74 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl1Q9JI74 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Klhl1Q9JI74 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl1Q9JI74 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Klhl1Q9JI74 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl1Q9JI74 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl1Q9JI74 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl1Q9JI74 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl1Q9JI74 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl1Q9JI74 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl1Q9JI74 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl1Q9JI74 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl1Q9JI74 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl1Q9JI74 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl1Q9JI74 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Klhl1Q9JI74 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl1Q9JI74 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl1Q9JI74 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl1Q9JI74 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl1Q9JI74 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl1Q9JI74 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl1Q9JI74 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl1Q9JI74 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Klhl1Q9JI74 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl1Q9JI74 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl1Q9JI74 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl1Q9JI74 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl1Q9JI74 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl1Q9JI74 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl1Q9JI74 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Klhl1Q9JI74 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klhl1Q9JI74 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klhl1Q9JI74 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Klhl1Q9JI74 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms