Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tcirg1Q9JHF5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tcirg1Q9JHF5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tcirg1Q9JHF5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tcirg1Q9JHF5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tcirg1Q9JHF5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tcirg1Q9JHF5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tcirg1Q9JHF5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tcirg1Q9JHF5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tcirg1Q9JHF5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tcirg1Q9JHF5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tcirg1Q9JHF5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tcirg1Q9JHF5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tcirg1Q9JHF5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tcirg1Q9JHF5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tcirg1Q9JHF5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tcirg1Q9JHF5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tcirg1Q9JHF5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcirg1Q9JHF5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcirg1Q9JHF5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcirg1Q9JHF5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcirg1Q9JHF5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcirg1Q9JHF5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcirg1Q9JHF5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tcirg1Q9JHF5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tcirg1Q9JHF5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tcirg1Q9JHF5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tcirg1Q9JHF5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tcirg1Q9JHF5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tcirg1Q9JHF5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tcirg1Q9JHF5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tcirg1Q9JHF5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tcirg1Q9JHF5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tcirg1Q9JHF5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tcirg1Q9JHF5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tcirg1Q9JHF5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcirg1Q9JHF5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcirg1Q9JHF5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcirg1Q9JHF5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcirg1Q9JHF5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcirg1Q9JHF5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcirg1Q9JHF5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcirg1Q9JHF5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcirg1Q9JHF5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcirg1Q9JHF5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcirg1Q9JHF5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcirg1Q9JHF5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcirg1Q9JHF5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcirg1Q9JHF5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcirg1Q9JHF5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcirg1Q9JHF5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcirg1Q9JHF5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcirg1Q9JHF5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcirg1Q9JHF5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcirg1Q9JHF5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcirg1Q9JHF5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcirg1Q9JHF5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcirg1Q9JHF5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcirg1Q9JHF5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcirg1Q9JHF5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcirg1Q9JHF5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcirg1Q9JHF5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcirg1Q9JHF5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcirg1Q9JHF5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tcirg1Q9JHF5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tcirg1Q9JHF5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tcirg1Q9JHF5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tcirg1Q9JHF5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tcirg1Q9JHF5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tcirg1Q9JHF5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Tcirg1Q9JHF5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tcirg1Q9JHF5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tcirg1Q9JHF5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tcirg1Q9JHF5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tcirg1Q9JHF5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tcirg1Q9JHF5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tcirg1Q9JHF5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tcirg1Q9JHF5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tcirg1Q9JHF5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tcirg1Q9JHF5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tcirg1Q9JHF5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tcirg1Q9JHF5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tcirg1Q9JHF5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tcirg1Q9JHF5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tcirg1Q9JHF5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tcirg1Q9JHF5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tcirg1Q9JHF5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tcirg1Q9JHF5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tcirg1Q9JHF5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tcirg1Q9JHF5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tcirg1Q9JHF5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tcirg1Q9JHF5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tcirg1Q9JHF5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tcirg1Q9JHF5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tcirg1Q9JHF5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tcirg1Q9JHF5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tcirg1Q9JHF5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tcirg1Q9JHF5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tcirg1Q9JHF5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tcirg1Q9JHF5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms