Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

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Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tm9sf3Q9ET30 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tm9sf3Q9ET30 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tm9sf3Q9ET30 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tm9sf3Q9ET30 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tm9sf3Q9ET30 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tm9sf3Q9ET30 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tm9sf3Q9ET30 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tm9sf3Q9ET30 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tm9sf3Q9ET30 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tm9sf3Q9ET30 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tm9sf3Q9ET30 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tm9sf3Q9ET30 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tm9sf3Q9ET30 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tm9sf3Q9ET30 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tm9sf3Q9ET30 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tm9sf3Q9ET30 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tm9sf3Q9ET30 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tm9sf3Q9ET30 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tm9sf3Q9ET30 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tm9sf3Q9ET30 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tm9sf3Q9ET30 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tm9sf3Q9ET30 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tm9sf3Q9ET30 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tm9sf3Q9ET30 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tm9sf3Q9ET30 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tm9sf3Q9ET30 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tm9sf3Q9ET30 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tm9sf3Q9ET30 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tm9sf3Q9ET30 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tm9sf3Q9ET30 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tm9sf3Q9ET30 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tm9sf3Q9ET30 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tm9sf3Q9ET30 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tm9sf3Q9ET30 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tm9sf3Q9ET30 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tm9sf3Q9ET30 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tm9sf3Q9ET30 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tm9sf3Q9ET30 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tm9sf3Q9ET30 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tm9sf3Q9ET30 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tm9sf3Q9ET30 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tm9sf3Q9ET30 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tm9sf3Q9ET30 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tm9sf3Q9ET30 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tm9sf3Q9ET30 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tm9sf3Q9ET30 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tm9sf3Q9ET30 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tm9sf3Q9ET30 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tm9sf3Q9ET30 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tm9sf3Q9ET30 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tm9sf3Q9ET30 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tm9sf3Q9ET30 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tm9sf3Q9ET30 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tm9sf3Q9ET30 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tm9sf3Q9ET30 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tm9sf3Q9ET30 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tm9sf3Q9ET30 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tm9sf3Q9ET30 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tm9sf3Q9ET30 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tm9sf3Q9ET30 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tm9sf3Q9ET30 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tm9sf3Q9ET30 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tm9sf3Q9ET30 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tm9sf3Q9ET30 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tm9sf3Q9ET30 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tm9sf3Q9ET30 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tm9sf3Q9ET30 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tm9sf3Q9ET30 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tm9sf3Q9ET30 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tm9sf3Q9ET30 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tm9sf3Q9ET30 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tm9sf3Q9ET30 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tm9sf3Q9ET30 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tm9sf3Q9ET30 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tm9sf3Q9ET30 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tm9sf3Q9ET30 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tm9sf3Q9ET30 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tm9sf3Q9ET30 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tm9sf3Q9ET30 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tm9sf3Q9ET30 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tm9sf3Q9ET30 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tm9sf3Q9ET30 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tm9sf3Q9ET30 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tm9sf3Q9ET30 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tm9sf3Q9ET30 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tm9sf3Q9ET30 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tm9sf3Q9ET30 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tm9sf3Q9ET30 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tm9sf3Q9ET30 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tm9sf3Q9ET30 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tm9sf3Q9ET30 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tm9sf3Q9ET30 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tm9sf3Q9ET30 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tm9sf3Q9ET30 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Tm9sf3Q9ET30 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tm9sf3Q9ET30 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Tm9sf3Q9ET30 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tm9sf3Q9ET30 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tm9sf3Q9ET30 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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