Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim39Q9ESN2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim39Q9ESN2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim39Q9ESN2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim39Q9ESN2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim39Q9ESN2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim39Q9ESN2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim39Q9ESN2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim39Q9ESN2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim39Q9ESN2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim39Q9ESN2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim39Q9ESN2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim39Q9ESN2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim39Q9ESN2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim39Q9ESN2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim39Q9ESN2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim39Q9ESN2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim39Q9ESN2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim39Q9ESN2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim39Q9ESN2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim39Q9ESN2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim39Q9ESN2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim39Q9ESN2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim39Q9ESN2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim39Q9ESN2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim39Q9ESN2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim39Q9ESN2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim39Q9ESN2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim39Q9ESN2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim39Q9ESN2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim39Q9ESN2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim39Q9ESN2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim39Q9ESN2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim39Q9ESN2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim39Q9ESN2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim39Q9ESN2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim39Q9ESN2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim39Q9ESN2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim39Q9ESN2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim39Q9ESN2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim39Q9ESN2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim39Q9ESN2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim39Q9ESN2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim39Q9ESN2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim39Q9ESN2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim39Q9ESN2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim39Q9ESN2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim39Q9ESN2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim39Q9ESN2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim39Q9ESN2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim39Q9ESN2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim39Q9ESN2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim39Q9ESN2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim39Q9ESN2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim39Q9ESN2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim39Q9ESN2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim39Q9ESN2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim39Q9ESN2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim39Q9ESN2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim39Q9ESN2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim39Q9ESN2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trim39Q9ESN2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim39Q9ESN2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim39Q9ESN2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim39Q9ESN2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim39Q9ESN2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim39Q9ESN2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim39Q9ESN2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim39Q9ESN2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim39Q9ESN2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim39Q9ESN2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim39Q9ESN2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim39Q9ESN2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim39Q9ESN2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim39Q9ESN2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trim39Q9ESN2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim39Q9ESN2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim39Q9ESN2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim39Q9ESN2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim39Q9ESN2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim39Q9ESN2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim39Q9ESN2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim39Q9ESN2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim39Q9ESN2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim39Q9ESN2 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim39Q9ESN2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trim39Q9ESN2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim39Q9ESN2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim39Q9ESN2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim39Q9ESN2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim39Q9ESN2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim39Q9ESN2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim39Q9ESN2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trim39Q9ESN2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim39Q9ESN2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim39Q9ESN2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim39Q9ESN2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim39Q9ESN2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim39Q9ESN2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trim39Q9ESN2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms