Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc4Q9ES56 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc4Q9ES56 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc4Q9ES56 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc4Q9ES56 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trappc4Q9ES56 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc4Q9ES56 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc4Q9ES56 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc4Q9ES56 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc4Q9ES56 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc4Q9ES56 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc4Q9ES56 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc4Q9ES56 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc4Q9ES56 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc4Q9ES56 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc4Q9ES56 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc4Q9ES56 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc4Q9ES56 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc4Q9ES56 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc4Q9ES56 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc4Q9ES56 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc4Q9ES56 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc4Q9ES56 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc4Q9ES56 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc4Q9ES56 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc4Q9ES56 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc4Q9ES56 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc4Q9ES56 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc4Q9ES56 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc4Q9ES56 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc4Q9ES56 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc4Q9ES56 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc4Q9ES56 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc4Q9ES56 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc4Q9ES56 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc4Q9ES56 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc4Q9ES56 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc4Q9ES56 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc4Q9ES56 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc4Q9ES56 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc4Q9ES56 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc4Q9ES56 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc4Q9ES56 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc4Q9ES56 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc4Q9ES56 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc4Q9ES56 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc4Q9ES56 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc4Q9ES56 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc4Q9ES56 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc4Q9ES56 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc4Q9ES56 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc4Q9ES56 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc4Q9ES56 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc4Q9ES56 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc4Q9ES56 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc4Q9ES56 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc4Q9ES56 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trappc4Q9ES56 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc4Q9ES56 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc4Q9ES56 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc4Q9ES56 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc4Q9ES56 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc4Q9ES56 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc4Q9ES56 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc4Q9ES56 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc4Q9ES56 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc4Q9ES56 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc4Q9ES56 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc4Q9ES56 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc4Q9ES56 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc4Q9ES56 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc4Q9ES56 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc4Q9ES56 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc4Q9ES56 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc4Q9ES56 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc4Q9ES56 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc4Q9ES56 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc4Q9ES56 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc4Q9ES56 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc4Q9ES56 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc4Q9ES56 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc4Q9ES56 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc4Q9ES56 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc4Q9ES56 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc4Q9ES56 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc4Q9ES56 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc4Q9ES56 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc4Q9ES56 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc4Q9ES56 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc4Q9ES56 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc4Q9ES56 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc4Q9ES56 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc4Q9ES56 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc4Q9ES56 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc4Q9ES56 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc4Q9ES56 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc4Q9ES56 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc4Q9ES56 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc4Q9ES56 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms