Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim54Q9ERP3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trim54Q9ERP3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim54Q9ERP3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim54Q9ERP3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trim54Q9ERP3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim54Q9ERP3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim54Q9ERP3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms