Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER75

Irx6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx6Q9ER75 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Irx6Q9ER75 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Irx6Q9ER75 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Irx6Q9ER75 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Irx6Q9ER75 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Irx6Q9ER75 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Irx6Q9ER75 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Irx6Q9ER75 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Irx6Q9ER75 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Irx6Q9ER75 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Irx6Q9ER75 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Irx6Q9ER75 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Irx6Q9ER75 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Irx6Q9ER75 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Irx6Q9ER75 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Irx6Q9ER75 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Irx6Q9ER75 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Irx6Q9ER75 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Irx6Q9ER75 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Irx6Q9ER75 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Irx6Q9ER75 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Irx6Q9ER75 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Irx6Q9ER75 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Irx6Q9ER75 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Irx6Q9ER75 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Irx6Q9ER75 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Irx6Q9ER75 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Irx6Q9ER75 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Irx6Q9ER75 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Irx6Q9ER75 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Irx6Q9ER75 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Irx6Q9ER75 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Irx6Q9ER75 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Irx6Q9ER75 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Irx6Q9ER75 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Irx6Q9ER75 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Irx6Q9ER75 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Irx6Q9ER75 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Irx6Q9ER75 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Irx6Q9ER75 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Irx6Q9ER75 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Irx6Q9ER75 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Irx6Q9ER75 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Irx6Q9ER75 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Irx6Q9ER75 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Irx6Q9ER75 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Irx6Q9ER75 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Irx6Q9ER75 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Irx6Q9ER75 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Irx6Q9ER75 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Irx6Q9ER75 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Irx6Q9ER75 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Irx6Q9ER75 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Irx6Q9ER75 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Irx6Q9ER75 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Irx6Q9ER75 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Irx6Q9ER75 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Irx6Q9ER75 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Irx6Q9ER75 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Irx6Q9ER75 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Irx6Q9ER75 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Irx6Q9ER75 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Irx6Q9ER75 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Irx6Q9ER75 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Irx6Q9ER75 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Irx6Q9ER75 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Irx6Q9ER75 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Irx6Q9ER75 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Irx6Q9ER75 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Irx6Q9ER75 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Irx6Q9ER75 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Irx6Q9ER75 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Irx6Q9ER75 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Irx6Q9ER75 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Irx6Q9ER75 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Irx6Q9ER75 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Irx6Q9ER75 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Irx6Q9ER75 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Irx6Q9ER75 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Irx6Q9ER75 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Irx6Q9ER75 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Irx6Q9ER75 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Irx6Q9ER75 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Irx6Q9ER75 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Irx6Q9ER75 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Irx6Q9ER75 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Irx6Q9ER75 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Irx6Q9ER75 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Irx6Q9ER75 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Irx6Q9ER75 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Irx6Q9ER75 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Irx6Q9ER75 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Irx6Q9ER75 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Irx6Q9ER75 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Irx6Q9ER75 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Irx6Q9ER75 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Irx6Q9ER75 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Irx6Q9ER75 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Irx6Q9ER75 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Irx6Q9ER75 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms