Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf23Q9ER63 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf23Q9ER63 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms