Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Capn12Q9ER56 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Capn12Q9ER56 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Capn12Q9ER56 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Capn12Q9ER56 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Capn12Q9ER56 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Capn12Q9ER56 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Capn12Q9ER56 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Capn12Q9ER56 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Capn12Q9ER56 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Capn12Q9ER56 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Capn12Q9ER56 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capn12Q9ER56 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Capn12Q9ER56 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capn12Q9ER56 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capn12Q9ER56 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capn12Q9ER56 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capn12Q9ER56 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Capn12Q9ER56 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Capn12Q9ER56 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Capn12Q9ER56 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Capn12Q9ER56 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Capn12Q9ER56 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn12Q9ER56 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn12Q9ER56 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn12Q9ER56 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn12Q9ER56 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn12Q9ER56 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn12Q9ER56 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn12Q9ER56 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn12Q9ER56 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn12Q9ER56 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn12Q9ER56 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Capn12Q9ER56 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Capn12Q9ER56 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Capn12Q9ER56 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Capn12Q9ER56 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Capn12Q9ER56 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Capn12Q9ER56 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Capn12Q9ER56 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Capn12Q9ER56 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Capn12Q9ER56 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Capn12Q9ER56 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Capn12Q9ER56 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Capn12Q9ER56 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn12Q9ER56 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn12Q9ER56 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Capn12Q9ER56 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Capn12Q9ER56 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Capn12Q9ER56 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Capn12Q9ER56 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Capn12Q9ER56 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn12Q9ER56 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn12Q9ER56 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn12Q9ER56 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn12Q9ER56 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn12Q9ER56 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn12Q9ER56 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn12Q9ER56 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Capn12Q9ER56 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Capn12Q9ER56 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Capn12Q9ER56 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Capn12Q9ER56 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Capn12Q9ER56 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Capn12Q9ER56 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Capn12Q9ER56 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Capn12Q9ER56 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Capn12Q9ER56 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Capn12Q9ER56 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Capn12Q9ER56 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Capn12Q9ER56 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Capn12Q9ER56 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Capn12Q9ER56 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Capn12Q9ER56 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Capn12Q9ER56 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Capn12Q9ER56 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Capn12Q9ER56 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Capn12Q9ER56 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Capn12Q9ER56 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Capn12Q9ER56 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Capn12Q9ER56 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Capn12Q9ER56 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Capn12Q9ER56 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Capn12Q9ER56 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Capn12Q9ER56 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn12Q9ER56 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn12Q9ER56 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn12Q9ER56 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn12Q9ER56 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Capn12Q9ER56 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn12Q9ER56 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn12Q9ER56 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn12Q9ER56 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Capn12Q9ER56 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn12Q9ER56 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn12Q9ER56 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn12Q9ER56 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn12Q9ER56 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn12Q9ER56 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Capn12Q9ER56 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms