Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ80

Nif3l1, NIF3-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nif3l1Q9EQ80 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nif3l1Q9EQ80 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nif3l1Q9EQ80 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nif3l1Q9EQ80 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nif3l1Q9EQ80 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nif3l1Q9EQ80 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nif3l1Q9EQ80 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Nif3l1Q9EQ80 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nif3l1Q9EQ80 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nif3l1Q9EQ80 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nif3l1Q9EQ80 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nif3l1Q9EQ80 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nif3l1Q9EQ80 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nif3l1Q9EQ80 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nif3l1Q9EQ80 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nif3l1Q9EQ80 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nif3l1Q9EQ80 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nif3l1Q9EQ80 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nif3l1Q9EQ80 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nif3l1Q9EQ80 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nif3l1Q9EQ80 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nif3l1Q9EQ80 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nif3l1Q9EQ80 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nif3l1Q9EQ80 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nif3l1Q9EQ80 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nif3l1Q9EQ80 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nif3l1Q9EQ80 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nif3l1Q9EQ80 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nif3l1Q9EQ80 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nif3l1Q9EQ80 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nif3l1Q9EQ80 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nif3l1Q9EQ80 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nif3l1Q9EQ80 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nif3l1Q9EQ80 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nif3l1Q9EQ80 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nif3l1Q9EQ80 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nif3l1Q9EQ80 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nif3l1Q9EQ80 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nif3l1Q9EQ80 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nif3l1Q9EQ80 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nif3l1Q9EQ80 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nif3l1Q9EQ80 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nif3l1Q9EQ80 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nif3l1Q9EQ80 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Nif3l1Q9EQ80 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nif3l1Q9EQ80 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nif3l1Q9EQ80 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nif3l1Q9EQ80 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nif3l1Q9EQ80 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nif3l1Q9EQ80 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nif3l1Q9EQ80 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nif3l1Q9EQ80 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nif3l1Q9EQ80 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nif3l1Q9EQ80 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nif3l1Q9EQ80 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nif3l1Q9EQ80 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nif3l1Q9EQ80 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nif3l1Q9EQ80 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms