Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clstn1Q9EPL2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clstn1Q9EPL2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clstn1Q9EPL2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clstn1Q9EPL2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Clstn1Q9EPL2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Clstn1Q9EPL2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clstn1Q9EPL2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clstn1Q9EPL2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Clstn1Q9EPL2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Clstn1Q9EPL2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Clstn1Q9EPL2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Clstn1Q9EPL2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Clstn1Q9EPL2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Clstn1Q9EPL2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Clstn1Q9EPL2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Clstn1Q9EPL2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Clstn1Q9EPL2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Clstn1Q9EPL2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Clstn1Q9EPL2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Clstn1Q9EPL2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Clstn1Q9EPL2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Clstn1Q9EPL2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clstn1Q9EPL2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Clstn1Q9EPL2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clstn1Q9EPL2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clstn1Q9EPL2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Clstn1Q9EPL2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clstn1Q9EPL2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clstn1Q9EPL2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clstn1Q9EPL2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clstn1Q9EPL2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clstn1Q9EPL2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Clstn1Q9EPL2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clstn1Q9EPL2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clstn1Q9EPL2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clstn1Q9EPL2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clstn1Q9EPL2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clstn1Q9EPL2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clstn1Q9EPL2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clstn1Q9EPL2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Clstn1Q9EPL2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clstn1Q9EPL2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Clstn1Q9EPL2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Clstn1Q9EPL2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Clstn1Q9EPL2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Clstn1Q9EPL2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Clstn1Q9EPL2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Clstn1Q9EPL2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Clstn1Q9EPL2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Clstn1Q9EPL2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clstn1Q9EPL2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clstn1Q9EPL2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clstn1Q9EPL2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clstn1Q9EPL2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clstn1Q9EPL2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Clstn1Q9EPL2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clstn1Q9EPL2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clstn1Q9EPL2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Clstn1Q9EPL2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clstn1Q9EPL2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clstn1Q9EPL2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clstn1Q9EPL2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clstn1Q9EPL2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clstn1Q9EPL2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Clstn1Q9EPL2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clstn1Q9EPL2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clstn1Q9EPL2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clstn1Q9EPL2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clstn1Q9EPL2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Clstn1Q9EPL2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clstn1Q9EPL2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Clstn1Q9EPL2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clstn1Q9EPL2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clstn1Q9EPL2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clstn1Q9EPL2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Clstn1Q9EPL2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clstn1Q9EPL2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clstn1Q9EPL2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clstn1Q9EPL2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Clstn1Q9EPL2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clstn1Q9EPL2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clstn1Q9EPL2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clstn1Q9EPL2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clstn1Q9EPL2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clstn1Q9EPL2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clstn1Q9EPL2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Clstn1Q9EPL2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clstn1Q9EPL2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clstn1Q9EPL2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clstn1Q9EPL2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clstn1Q9EPL2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clstn1Q9EPL2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Clstn1Q9EPL2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Clstn1Q9EPL2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Clstn1Q9EPL2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clstn1Q9EPL2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clstn1Q9EPL2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.7 ms