Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pop7Q9DCH2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pop7Q9DCH2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pop7Q9DCH2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pop7Q9DCH2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pop7Q9DCH2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pop7Q9DCH2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pop7Q9DCH2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pop7Q9DCH2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pop7Q9DCH2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pop7Q9DCH2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pop7Q9DCH2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Pop7Q9DCH2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pop7Q9DCH2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pop7Q9DCH2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pop7Q9DCH2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pop7Q9DCH2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pop7Q9DCH2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pop7Q9DCH2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pop7Q9DCH2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pop7Q9DCH2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pop7Q9DCH2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pop7Q9DCH2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pop7Q9DCH2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pop7Q9DCH2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pop7Q9DCH2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pop7Q9DCH2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pop7Q9DCH2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pop7Q9DCH2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pop7Q9DCH2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pop7Q9DCH2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pop7Q9DCH2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pop7Q9DCH2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pop7Q9DCH2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pop7Q9DCH2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pop7Q9DCH2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pop7Q9DCH2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pop7Q9DCH2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pop7Q9DCH2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pop7Q9DCH2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pop7Q9DCH2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pop7Q9DCH2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pop7Q9DCH2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pop7Q9DCH2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pop7Q9DCH2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pop7Q9DCH2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pop7Q9DCH2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pop7Q9DCH2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pop7Q9DCH2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pop7Q9DCH2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pop7Q9DCH2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pop7Q9DCH2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pop7Q9DCH2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pop7Q9DCH2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pop7Q9DCH2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pop7Q9DCH2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pop7Q9DCH2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pop7Q9DCH2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pop7Q9DCH2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pop7Q9DCH2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pop7Q9DCH2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pop7Q9DCH2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pop7Q9DCH2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pop7Q9DCH2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pop7Q9DCH2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pop7Q9DCH2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pop7Q9DCH2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pop7Q9DCH2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pop7Q9DCH2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pop7Q9DCH2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pop7Q9DCH2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pop7Q9DCH2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pop7Q9DCH2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pop7Q9DCH2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pop7Q9DCH2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pop7Q9DCH2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Pop7Q9DCH2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Pop7Q9DCH2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pop7Q9DCH2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pop7Q9DCH2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pop7Q9DCH2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pop7Q9DCH2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pop7Q9DCH2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pop7Q9DCH2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Pop7Q9DCH2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pop7Q9DCH2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pop7Q9DCH2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pop7Q9DCH2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pop7Q9DCH2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pop7Q9DCH2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pop7Q9DCH2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pop7Q9DCH2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pop7Q9DCH2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pop7Q9DCH2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pop7Q9DCH2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pop7Q9DCH2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pop7Q9DCH2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pop7Q9DCH2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pop7Q9DCH2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pop7Q9DCH2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms