Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC16

Ergic1, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic1Q9DC16 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ergic1Q9DC16 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ergic1Q9DC16 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ergic1Q9DC16 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ergic1Q9DC16 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ergic1Q9DC16 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ergic1Q9DC16 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ergic1Q9DC16 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ergic1Q9DC16 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ergic1Q9DC16 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ergic1Q9DC16 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ergic1Q9DC16 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ergic1Q9DC16 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ergic1Q9DC16 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ergic1Q9DC16 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ergic1Q9DC16 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ergic1Q9DC16 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ergic1Q9DC16 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ergic1Q9DC16 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ergic1Q9DC16 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ergic1Q9DC16 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ergic1Q9DC16 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ergic1Q9DC16 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ergic1Q9DC16 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ergic1Q9DC16 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ergic1Q9DC16 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ergic1Q9DC16 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ergic1Q9DC16 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ergic1Q9DC16 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ergic1Q9DC16 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ergic1Q9DC16 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ergic1Q9DC16 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ergic1Q9DC16 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ergic1Q9DC16 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ergic1Q9DC16 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ergic1Q9DC16 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ergic1Q9DC16 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ergic1Q9DC16 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ergic1Q9DC16 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ergic1Q9DC16 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms