Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tm9sf1Q9DBU0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tm9sf1Q9DBU0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tm9sf1Q9DBU0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tm9sf1Q9DBU0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tm9sf1Q9DBU0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tm9sf1Q9DBU0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tm9sf1Q9DBU0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tm9sf1Q9DBU0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tm9sf1Q9DBU0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tm9sf1Q9DBU0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tm9sf1Q9DBU0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tm9sf1Q9DBU0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tm9sf1Q9DBU0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tm9sf1Q9DBU0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tm9sf1Q9DBU0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tm9sf1Q9DBU0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tm9sf1Q9DBU0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tm9sf1Q9DBU0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tm9sf1Q9DBU0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tm9sf1Q9DBU0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tm9sf1Q9DBU0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tm9sf1Q9DBU0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tm9sf1Q9DBU0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tm9sf1Q9DBU0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tm9sf1Q9DBU0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tm9sf1Q9DBU0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tm9sf1Q9DBU0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tm9sf1Q9DBU0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tm9sf1Q9DBU0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tm9sf1Q9DBU0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tm9sf1Q9DBU0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tm9sf1Q9DBU0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tm9sf1Q9DBU0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tm9sf1Q9DBU0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tm9sf1Q9DBU0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tm9sf1Q9DBU0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tm9sf1Q9DBU0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tm9sf1Q9DBU0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tm9sf1Q9DBU0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tm9sf1Q9DBU0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tm9sf1Q9DBU0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tm9sf1Q9DBU0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tm9sf1Q9DBU0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tm9sf1Q9DBU0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tm9sf1Q9DBU0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tm9sf1Q9DBU0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tm9sf1Q9DBU0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tm9sf1Q9DBU0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tm9sf1Q9DBU0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tm9sf1Q9DBU0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tm9sf1Q9DBU0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tm9sf1Q9DBU0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tm9sf1Q9DBU0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tm9sf1Q9DBU0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tm9sf1Q9DBU0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tm9sf1Q9DBU0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tm9sf1Q9DBU0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tm9sf1Q9DBU0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tm9sf1Q9DBU0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tm9sf1Q9DBU0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tm9sf1Q9DBU0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tm9sf1Q9DBU0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tm9sf1Q9DBU0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tm9sf1Q9DBU0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tm9sf1Q9DBU0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tm9sf1Q9DBU0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tm9sf1Q9DBU0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tm9sf1Q9DBU0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tm9sf1Q9DBU0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tm9sf1Q9DBU0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tm9sf1Q9DBU0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tm9sf1Q9DBU0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tm9sf1Q9DBU0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tm9sf1Q9DBU0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tm9sf1Q9DBU0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tm9sf1Q9DBU0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tm9sf1Q9DBU0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tm9sf1Q9DBU0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tm9sf1Q9DBU0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tm9sf1Q9DBU0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tm9sf1Q9DBU0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tm9sf1Q9DBU0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tm9sf1Q9DBU0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tm9sf1Q9DBU0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tm9sf1Q9DBU0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tm9sf1Q9DBU0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tm9sf1Q9DBU0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tm9sf1Q9DBU0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tm9sf1Q9DBU0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tm9sf1Q9DBU0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tm9sf1Q9DBU0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tm9sf1Q9DBU0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tm9sf1Q9DBU0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tm9sf1Q9DBU0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tm9sf1Q9DBU0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tm9sf1Q9DBU0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tm9sf1Q9DBU0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
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