Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAC0

Cmtm2b, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2bQ9DAC0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmtm2bQ9DAC0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmtm2bQ9DAC0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmtm2bQ9DAC0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmtm2bQ9DAC0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmtm2bQ9DAC0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmtm2bQ9DAC0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cmtm2bQ9DAC0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cmtm2bQ9DAC0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cmtm2bQ9DAC0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cmtm2bQ9DAC0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cmtm2bQ9DAC0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cmtm2bQ9DAC0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cmtm2bQ9DAC0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cmtm2bQ9DAC0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cmtm2bQ9DAC0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cmtm2bQ9DAC0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cmtm2bQ9DAC0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cmtm2bQ9DAC0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cmtm2bQ9DAC0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cmtm2bQ9DAC0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cmtm2bQ9DAC0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cmtm2bQ9DAC0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cmtm2bQ9DAC0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cmtm2bQ9DAC0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cmtm2bQ9DAC0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cmtm2bQ9DAC0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cmtm2bQ9DAC0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cmtm2bQ9DAC0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmtm2bQ9DAC0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmtm2bQ9DAC0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmtm2bQ9DAC0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmtm2bQ9DAC0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmtm2bQ9DAC0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmtm2bQ9DAC0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmtm2bQ9DAC0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmtm2bQ9DAC0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cmtm2bQ9DAC0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm2bQ9DAC0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm2bQ9DAC0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm2bQ9DAC0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cmtm2bQ9DAC0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm2bQ9DAC0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm2bQ9DAC0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm2bQ9DAC0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm2bQ9DAC0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm2bQ9DAC0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm2bQ9DAC0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm2bQ9DAC0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm2bQ9DAC0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm2bQ9DAC0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cmtm2bQ9DAC0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm2bQ9DAC0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm2bQ9DAC0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm2bQ9DAC0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm2bQ9DAC0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm2bQ9DAC0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm2bQ9DAC0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm2bQ9DAC0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cmtm2bQ9DAC0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm2bQ9DAC0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm2bQ9DAC0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm2bQ9DAC0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm2bQ9DAC0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm2bQ9DAC0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm2bQ9DAC0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm2bQ9DAC0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cmtm2bQ9DAC0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cmtm2bQ9DAC0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm2bQ9DAC0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm2bQ9DAC0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm2bQ9DAC0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm2bQ9DAC0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cmtm2bQ9DAC0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm2bQ9DAC0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm2bQ9DAC0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cmtm2bQ9DAC0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm2bQ9DAC0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm2bQ9DAC0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm2bQ9DAC0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm2bQ9DAC0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm2bQ9DAC0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm2bQ9DAC0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm2bQ9DAC0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm2bQ9DAC0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm2bQ9DAC0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cmtm2bQ9DAC0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmtm2bQ9DAC0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmtm2bQ9DAC0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmtm2bQ9DAC0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmtm2bQ9DAC0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cmtm2bQ9DAC0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmtm2bQ9DAC0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmtm2bQ9DAC0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmtm2bQ9DAC0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmtm2bQ9DAC0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmtm2bQ9DAC0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmtm2bQ9DAC0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cmtm2bQ9DAC0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms