Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA39

Tmbim4, Protein lifeguard 4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmbim4Q9DA39 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Tmbim4Q9DA39 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmbim4Q9DA39 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmbim4Q9DA39 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmbim4Q9DA39 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmbim4Q9DA39 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmbim4Q9DA39 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmbim4Q9DA39 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmbim4Q9DA39 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmbim4Q9DA39 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmbim4Q9DA39 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmbim4Q9DA39 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmbim4Q9DA39 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmbim4Q9DA39 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmbim4Q9DA39 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmbim4Q9DA39 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmbim4Q9DA39 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmbim4Q9DA39 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmbim4Q9DA39 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmbim4Q9DA39 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmbim4Q9DA39 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmbim4Q9DA39 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmbim4Q9DA39 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmbim4Q9DA39 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmbim4Q9DA39 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmbim4Q9DA39 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmbim4Q9DA39 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmbim4Q9DA39 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmbim4Q9DA39 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmbim4Q9DA39 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmbim4Q9DA39 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmbim4Q9DA39 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmbim4Q9DA39 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmbim4Q9DA39 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmbim4Q9DA39 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmbim4Q9DA39 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmbim4Q9DA39 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmbim4Q9DA39 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmbim4Q9DA39 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmbim4Q9DA39 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmbim4Q9DA39 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmbim4Q9DA39 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmbim4Q9DA39 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmbim4Q9DA39 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmbim4Q9DA39 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmbim4Q9DA39 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmbim4Q9DA39 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmbim4Q9DA39 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmbim4Q9DA39 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmbim4Q9DA39 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmbim4Q9DA39 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmbim4Q9DA39 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmbim4Q9DA39 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms