Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pdzd9Q9D9M4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Pdzd9Q9D9M4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pdzd9Q9D9M4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pdzd9Q9D9M4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pdzd9Q9D9M4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pdzd9Q9D9M4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Pdzd9Q9D9M4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pdzd9Q9D9M4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pdzd9Q9D9M4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Pdzd9Q9D9M4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pdzd9Q9D9M4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pdzd9Q9D9M4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pdzd9Q9D9M4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pdzd9Q9D9M4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pdzd9Q9D9M4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pdzd9Q9D9M4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Pdzd9Q9D9M4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pdzd9Q9D9M4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pdzd9Q9D9M4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pdzd9Q9D9M4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pdzd9Q9D9M4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pdzd9Q9D9M4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pdzd9Q9D9M4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pdzd9Q9D9M4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pdzd9Q9D9M4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pdzd9Q9D9M4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pdzd9Q9D9M4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Pdzd9Q9D9M4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pdzd9Q9D9M4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pdzd9Q9D9M4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pdzd9Q9D9M4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pdzd9Q9D9M4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pdzd9Q9D9M4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Pdzd9Q9D9M4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pdzd9Q9D9M4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pdzd9Q9D9M4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Pdzd9Q9D9M4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Pdzd9Q9D9M4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pdzd9Q9D9M4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pdzd9Q9D9M4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pdzd9Q9D9M4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pdzd9Q9D9M4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pdzd9Q9D9M4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pdzd9Q9D9M4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pdzd9Q9D9M4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Pdzd9Q9D9M4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pdzd9Q9D9M4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pdzd9Q9D9M4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pdzd9Q9D9M4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pdzd9Q9D9M4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pdzd9Q9D9M4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pdzd9Q9D9M4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Pdzd9Q9D9M4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pdzd9Q9D9M4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pdzd9Q9D9M4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Pdzd9Q9D9M4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pdzd9Q9D9M4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Pdzd9Q9D9M4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Pdzd9Q9D9M4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pdzd9Q9D9M4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pdzd9Q9D9M4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Pdzd9Q9D9M4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pdzd9Q9D9M4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pdzd9Q9D9M4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Pdzd9Q9D9M4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pdzd9Q9D9M4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pdzd9Q9D9M4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pdzd9Q9D9M4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pdzd9Q9D9M4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Pdzd9Q9D9M4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pdzd9Q9D9M4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pdzd9Q9D9M4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pdzd9Q9D9M4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pdzd9Q9D9M4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Pdzd9Q9D9M4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pdzd9Q9D9M4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Pdzd9Q9D9M4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Pdzd9Q9D9M4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pdzd9Q9D9M4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Pdzd9Q9D9M4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pdzd9Q9D9M4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Pdzd9Q9D9M4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pdzd9Q9D9M4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Pdzd9Q9D9M4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pdzd9Q9D9M4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Pdzd9Q9D9M4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pdzd9Q9D9M4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pdzd9Q9D9M4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pdzd9Q9D9M4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pdzd9Q9D9M4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Pdzd9Q9D9M4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
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