Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9E0

Slc22a17, Solute carrier family 22 member 17, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a17Q9D9E0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc22a17Q9D9E0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc22a17Q9D9E0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc22a17Q9D9E0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc22a17Q9D9E0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc22a17Q9D9E0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc22a17Q9D9E0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc22a17Q9D9E0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc22a17Q9D9E0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc22a17Q9D9E0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc22a17Q9D9E0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc22a17Q9D9E0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc22a17Q9D9E0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc22a17Q9D9E0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc22a17Q9D9E0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc22a17Q9D9E0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc22a17Q9D9E0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc22a17Q9D9E0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc22a17Q9D9E0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc22a17Q9D9E0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc22a17Q9D9E0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc22a17Q9D9E0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc22a17Q9D9E0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc22a17Q9D9E0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc22a17Q9D9E0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc22a17Q9D9E0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc22a17Q9D9E0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc22a17Q9D9E0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc22a17Q9D9E0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc22a17Q9D9E0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc22a17Q9D9E0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc22a17Q9D9E0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc22a17Q9D9E0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc22a17Q9D9E0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc22a17Q9D9E0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc22a17Q9D9E0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc22a17Q9D9E0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc22a17Q9D9E0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc22a17Q9D9E0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc22a17Q9D9E0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc22a17Q9D9E0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc22a17Q9D9E0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc22a17Q9D9E0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc22a17Q9D9E0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc22a17Q9D9E0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc22a17Q9D9E0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc22a17Q9D9E0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc22a17Q9D9E0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc22a17Q9D9E0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc22a17Q9D9E0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc22a17Q9D9E0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc22a17Q9D9E0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc22a17Q9D9E0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc22a17Q9D9E0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc22a17Q9D9E0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc22a17Q9D9E0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc22a17Q9D9E0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc22a17Q9D9E0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc22a17Q9D9E0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc22a17Q9D9E0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc22a17Q9D9E0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc22a17Q9D9E0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc22a17Q9D9E0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc22a17Q9D9E0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc22a17Q9D9E0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc22a17Q9D9E0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc22a17Q9D9E0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc22a17Q9D9E0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc22a17Q9D9E0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc22a17Q9D9E0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc22a17Q9D9E0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc22a17Q9D9E0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc22a17Q9D9E0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc22a17Q9D9E0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc22a17Q9D9E0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc22a17Q9D9E0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc22a17Q9D9E0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc22a17Q9D9E0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc22a17Q9D9E0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc22a17Q9D9E0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc22a17Q9D9E0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc22a17Q9D9E0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc22a17Q9D9E0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc22a17Q9D9E0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc22a17Q9D9E0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc22a17Q9D9E0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc22a17Q9D9E0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc22a17Q9D9E0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc22a17Q9D9E0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc22a17Q9D9E0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc22a17Q9D9E0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc22a17Q9D9E0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc22a17Q9D9E0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc22a17Q9D9E0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc22a17Q9D9E0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc22a17Q9D9E0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc22a17Q9D9E0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc22a17Q9D9E0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc22a17Q9D9E0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc22a17Q9D9E0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms