Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnot8Q9D8X5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnot8Q9D8X5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnot8Q9D8X5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnot8Q9D8X5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnot8Q9D8X5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnot8Q9D8X5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnot8Q9D8X5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnot8Q9D8X5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnot8Q9D8X5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnot8Q9D8X5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnot8Q9D8X5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnot8Q9D8X5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnot8Q9D8X5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnot8Q9D8X5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnot8Q9D8X5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnot8Q9D8X5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnot8Q9D8X5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnot8Q9D8X5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Cnot8Q9D8X5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnot8Q9D8X5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnot8Q9D8X5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnot8Q9D8X5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnot8Q9D8X5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnot8Q9D8X5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnot8Q9D8X5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnot8Q9D8X5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnot8Q9D8X5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnot8Q9D8X5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnot8Q9D8X5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnot8Q9D8X5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnot8Q9D8X5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnot8Q9D8X5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnot8Q9D8X5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnot8Q9D8X5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnot8Q9D8X5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnot8Q9D8X5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnot8Q9D8X5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnot8Q9D8X5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnot8Q9D8X5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnot8Q9D8X5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnot8Q9D8X5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnot8Q9D8X5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnot8Q9D8X5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnot8Q9D8X5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnot8Q9D8X5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnot8Q9D8X5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnot8Q9D8X5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnot8Q9D8X5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnot8Q9D8X5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnot8Q9D8X5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnot8Q9D8X5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnot8Q9D8X5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnot8Q9D8X5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnot8Q9D8X5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnot8Q9D8X5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cnot8Q9D8X5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cnot8Q9D8X5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cnot8Q9D8X5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.4 ms