Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rexo2Q9D8S4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rexo2Q9D8S4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rexo2Q9D8S4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rexo2Q9D8S4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rexo2Q9D8S4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rexo2Q9D8S4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rexo2Q9D8S4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rexo2Q9D8S4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rexo2Q9D8S4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rexo2Q9D8S4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rexo2Q9D8S4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rexo2Q9D8S4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rexo2Q9D8S4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rexo2Q9D8S4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rexo2Q9D8S4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rexo2Q9D8S4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rexo2Q9D8S4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rexo2Q9D8S4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rexo2Q9D8S4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rexo2Q9D8S4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rexo2Q9D8S4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rexo2Q9D8S4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rexo2Q9D8S4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rexo2Q9D8S4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rexo2Q9D8S4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rexo2Q9D8S4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rexo2Q9D8S4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rexo2Q9D8S4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rexo2Q9D8S4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rexo2Q9D8S4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rexo2Q9D8S4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rexo2Q9D8S4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rexo2Q9D8S4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rexo2Q9D8S4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rexo2Q9D8S4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rexo2Q9D8S4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rexo2Q9D8S4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rexo2Q9D8S4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rexo2Q9D8S4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rexo2Q9D8S4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rexo2Q9D8S4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rexo2Q9D8S4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rexo2Q9D8S4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rexo2Q9D8S4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rexo2Q9D8S4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rexo2Q9D8S4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rexo2Q9D8S4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rexo2Q9D8S4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rexo2Q9D8S4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rexo2Q9D8S4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rexo2Q9D8S4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rexo2Q9D8S4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rexo2Q9D8S4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rexo2Q9D8S4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rexo2Q9D8S4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rexo2Q9D8S4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rexo2Q9D8S4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rexo2Q9D8S4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rexo2Q9D8S4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rexo2Q9D8S4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rexo2Q9D8S4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rexo2Q9D8S4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rexo2Q9D8S4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rexo2Q9D8S4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rexo2Q9D8S4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rexo2Q9D8S4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rexo2Q9D8S4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rexo2Q9D8S4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rexo2Q9D8S4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rexo2Q9D8S4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Rexo2Q9D8S4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rexo2Q9D8S4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rexo2Q9D8S4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rexo2Q9D8S4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rexo2Q9D8S4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rexo2Q9D8S4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rexo2Q9D8S4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rexo2Q9D8S4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rexo2Q9D8S4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rexo2Q9D8S4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rexo2Q9D8S4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rexo2Q9D8S4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rexo2Q9D8S4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rexo2Q9D8S4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rexo2Q9D8S4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rexo2Q9D8S4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rexo2Q9D8S4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rexo2Q9D8S4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rexo2Q9D8S4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rexo2Q9D8S4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rexo2Q9D8S4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rexo2Q9D8S4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rexo2Q9D8S4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rexo2Q9D8S4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rexo2Q9D8S4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rexo2Q9D8S4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rexo2Q9D8S4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rexo2Q9D8S4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rexo2Q9D8S4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms