Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf3c6Q9D8P7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf3c6Q9D8P7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf3c6Q9D8P7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf3c6Q9D8P7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf3c6Q9D8P7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf3c6Q9D8P7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf3c6Q9D8P7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf3c6Q9D8P7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf3c6Q9D8P7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf3c6Q9D8P7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf3c6Q9D8P7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf3c6Q9D8P7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf3c6Q9D8P7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf3c6Q9D8P7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf3c6Q9D8P7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf3c6Q9D8P7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf3c6Q9D8P7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf3c6Q9D8P7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf3c6Q9D8P7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf3c6Q9D8P7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf3c6Q9D8P7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf3c6Q9D8P7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf3c6Q9D8P7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf3c6Q9D8P7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf3c6Q9D8P7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf3c6Q9D8P7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf3c6Q9D8P7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf3c6Q9D8P7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf3c6Q9D8P7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf3c6Q9D8P7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf3c6Q9D8P7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf3c6Q9D8P7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf3c6Q9D8P7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf3c6Q9D8P7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf3c6Q9D8P7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf3c6Q9D8P7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf3c6Q9D8P7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gtf3c6Q9D8P7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms