Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Chmp4cQ9D7F7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25,86■■□□□ 1,73
Chmp4cQ9D7F7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25,86■■□□□ 1,73
Chmp4cQ9D7F7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Chmp4cQ9D7F7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Chmp4cQ9D7F7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Chmp4cQ9D7F7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Chmp4cQ9D7F7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Chmp4cQ9D7F7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25,85■■□□□ 1,73
Chmp4cQ9D7F7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Chmp4cQ9D7F7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Chmp4cQ9D7F7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Chmp4cQ9D7F7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Chmp4cQ9D7F7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Chmp4cQ9D7F7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25,83■■□□□ 1,73
Chmp4cQ9D7F7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25,83■■□□□ 1,73
Chmp4cQ9D7F7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Chmp4cQ9D7F7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25,83■■□□□ 1,73
Chmp4cQ9D7F7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Chmp4cQ9D7F7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,83■■□□□ 1,72
Chmp4cQ9D7F7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25,82■■□□□ 1,72
Chmp4cQ9D7F7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Chmp4cQ9D7F7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Chmp4cQ9D7F7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Chmp4cQ9D7F7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25,82■■□□□ 1,72
Chmp4cQ9D7F7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25,82■■□□□ 1,72
Chmp4cQ9D7F7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25,82■■□□□ 1,72
Chmp4cQ9D7F7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Chmp4cQ9D7F7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Chmp4cQ9D7F7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Chmp4cQ9D7F7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Chmp4cQ9D7F7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Chmp4cQ9D7F7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Chmp4cQ9D7F7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Chmp4cQ9D7F7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Chmp4cQ9D7F7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Chmp4cQ9D7F7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Chmp4cQ9D7F7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25,79■■□□□ 1,72
Chmp4cQ9D7F7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25,79■■□□□ 1,72
Chmp4cQ9D7F7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Chmp4cQ9D7F7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Chmp4cQ9D7F7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25,78■■□□□ 1,72
Chmp4cQ9D7F7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Chmp4cQ9D7F7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25,78■■□□□ 1,72
Chmp4cQ9D7F7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25,78■■□□□ 1,72
Chmp4cQ9D7F7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Chmp4cQ9D7F7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25,78■■□□□ 1,72
Chmp4cQ9D7F7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Chmp4cQ9D7F7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Chmp4cQ9D7F7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Chmp4cQ9D7F7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Chmp4cQ9D7F7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Chmp4cQ9D7F7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Chmp4cQ9D7F7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,76■■□□□ 1,71
Chmp4cQ9D7F7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Chmp4cQ9D7F7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Chmp4cQ9D7F7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25,75■■□□□ 1,71
Chmp4cQ9D7F7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Chmp4cQ9D7F7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Chmp4cQ9D7F7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Chmp4cQ9D7F7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25,74■■□□□ 1,71
Chmp4cQ9D7F7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Chmp4cQ9D7F7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,74■■□□□ 1,71
Chmp4cQ9D7F7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Chmp4cQ9D7F7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25,73■■□□□ 1,71
Chmp4cQ9D7F7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Chmp4cQ9D7F7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Chmp4cQ9D7F7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Chmp4cQ9D7F7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Chmp4cQ9D7F7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Chmp4cQ9D7F7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Chmp4cQ9D7F7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Chmp4cQ9D7F7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Chmp4cQ9D7F7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Chmp4cQ9D7F7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Chmp4cQ9D7F7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25,71■■□□□ 1,71
Chmp4cQ9D7F7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Chmp4cQ9D7F7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Chmp4cQ9D7F7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Chmp4cQ9D7F7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Chmp4cQ9D7F7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25,71■■□□□ 1,71
Chmp4cQ9D7F7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25,71■■□□□ 1,71
Chmp4cQ9D7F7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Chmp4cQ9D7F7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25,7■■□□□ 1,71
Chmp4cQ9D7F7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
Chmp4cQ9D7F7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25,7■■□□□ 1,7
Chmp4cQ9D7F7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Chmp4cQ9D7F7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Chmp4cQ9D7F7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25,7■■□□□ 1,7
Chmp4cQ9D7F7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Chmp4cQ9D7F7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Chmp4cQ9D7F7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,69■■□□□ 1,7
Chmp4cQ9D7F7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Chmp4cQ9D7F7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25,69■■□□□ 1,7
Chmp4cQ9D7F7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Chmp4cQ9D7F7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,69■■□□□ 1,7
Chmp4cQ9D7F7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25,69■■□□□ 1,7
Chmp4cQ9D7F7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Chmp4cQ9D7F7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Chmp4cQ9D7F7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,2 ms