Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gbe1Q9D6Y9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbe1Q9D6Y9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbe1Q9D6Y9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbe1Q9D6Y9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbe1Q9D6Y9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbe1Q9D6Y9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gbe1Q9D6Y9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gbe1Q9D6Y9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gbe1Q9D6Y9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbe1Q9D6Y9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbe1Q9D6Y9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbe1Q9D6Y9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbe1Q9D6Y9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbe1Q9D6Y9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbe1Q9D6Y9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbe1Q9D6Y9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gbe1Q9D6Y9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gbe1Q9D6Y9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gbe1Q9D6Y9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbe1Q9D6Y9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbe1Q9D6Y9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbe1Q9D6Y9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbe1Q9D6Y9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbe1Q9D6Y9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbe1Q9D6Y9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbe1Q9D6Y9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbe1Q9D6Y9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbe1Q9D6Y9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbe1Q9D6Y9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbe1Q9D6Y9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbe1Q9D6Y9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gbe1Q9D6Y9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbe1Q9D6Y9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbe1Q9D6Y9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbe1Q9D6Y9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbe1Q9D6Y9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbe1Q9D6Y9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbe1Q9D6Y9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gbe1Q9D6Y9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbe1Q9D6Y9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbe1Q9D6Y9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbe1Q9D6Y9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbe1Q9D6Y9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbe1Q9D6Y9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbe1Q9D6Y9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbe1Q9D6Y9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbe1Q9D6Y9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gbe1Q9D6Y9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbe1Q9D6Y9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbe1Q9D6Y9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbe1Q9D6Y9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbe1Q9D6Y9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbe1Q9D6Y9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gbe1Q9D6Y9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbe1Q9D6Y9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbe1Q9D6Y9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbe1Q9D6Y9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbe1Q9D6Y9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbe1Q9D6Y9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbe1Q9D6Y9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbe1Q9D6Y9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gbe1Q9D6Y9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbe1Q9D6Y9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbe1Q9D6Y9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbe1Q9D6Y9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbe1Q9D6Y9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbe1Q9D6Y9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbe1Q9D6Y9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gbe1Q9D6Y9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbe1Q9D6Y9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbe1Q9D6Y9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbe1Q9D6Y9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbe1Q9D6Y9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbe1Q9D6Y9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbe1Q9D6Y9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbe1Q9D6Y9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbe1Q9D6Y9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gbe1Q9D6Y9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbe1Q9D6Y9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbe1Q9D6Y9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbe1Q9D6Y9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbe1Q9D6Y9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbe1Q9D6Y9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gbe1Q9D6Y9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbe1Q9D6Y9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbe1Q9D6Y9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbe1Q9D6Y9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbe1Q9D6Y9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gbe1Q9D6Y9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gbe1Q9D6Y9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gbe1Q9D6Y9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gbe1Q9D6Y9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gbe1Q9D6Y9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gbe1Q9D6Y9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gbe1Q9D6Y9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gbe1Q9D6Y9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms