Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Speer4f1Q9D5Q6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Speer4f1Q9D5Q6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Speer4f1Q9D5Q6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Speer4f1Q9D5Q6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Speer4f1Q9D5Q6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Speer4f1Q9D5Q6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Speer4f1Q9D5Q6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Speer4f1Q9D5Q6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Speer4f1Q9D5Q6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Speer4f1Q9D5Q6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Speer4f1Q9D5Q6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Speer4f1Q9D5Q6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Speer4f1Q9D5Q6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Speer4f1Q9D5Q6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Speer4f1Q9D5Q6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Speer4f1Q9D5Q6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Speer4f1Q9D5Q6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Speer4f1Q9D5Q6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Speer4f1Q9D5Q6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Speer4f1Q9D5Q6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Speer4f1Q9D5Q6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Speer4f1Q9D5Q6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Speer4f1Q9D5Q6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Speer4f1Q9D5Q6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Speer4f1Q9D5Q6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Speer4f1Q9D5Q6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Speer4f1Q9D5Q6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Speer4f1Q9D5Q6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Speer4f1Q9D5Q6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Speer4f1Q9D5Q6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Speer4f1Q9D5Q6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Speer4f1Q9D5Q6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Speer4f1Q9D5Q6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Speer4f1Q9D5Q6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Speer4f1Q9D5Q6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Speer4f1Q9D5Q6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Speer4f1Q9D5Q6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Speer4f1Q9D5Q6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Speer4f1Q9D5Q6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Speer4f1Q9D5Q6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Speer4f1Q9D5Q6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Speer4f1Q9D5Q6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Speer4f1Q9D5Q6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Speer4f1Q9D5Q6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Speer4f1Q9D5Q6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Speer4f1Q9D5Q6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Speer4f1Q9D5Q6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Speer4f1Q9D5Q6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Speer4f1Q9D5Q6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Speer4f1Q9D5Q6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Speer4f1Q9D5Q6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Speer4f1Q9D5Q6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Speer4f1Q9D5Q6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Speer4f1Q9D5Q6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Speer4f1Q9D5Q6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Speer4f1Q9D5Q6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Speer4f1Q9D5Q6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Speer4f1Q9D5Q6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Speer4f1Q9D5Q6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Speer4f1Q9D5Q6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Speer4f1Q9D5Q6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Speer4f1Q9D5Q6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Speer4f1Q9D5Q6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Speer4f1Q9D5Q6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Speer4f1Q9D5Q6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Speer4f1Q9D5Q6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Speer4f1Q9D5Q6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Speer4f1Q9D5Q6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Speer4f1Q9D5Q6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Speer4f1Q9D5Q6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Speer4f1Q9D5Q6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Speer4f1Q9D5Q6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Speer4f1Q9D5Q6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Speer4f1Q9D5Q6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Speer4f1Q9D5Q6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Speer4f1Q9D5Q6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Speer4f1Q9D5Q6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Speer4f1Q9D5Q6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Speer4f1Q9D5Q6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Speer4f1Q9D5Q6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Speer4f1Q9D5Q6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Speer4f1Q9D5Q6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Speer4f1Q9D5Q6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Speer4f1Q9D5Q6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Speer4f1Q9D5Q6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Speer4f1Q9D5Q6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Speer4f1Q9D5Q6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Speer4f1Q9D5Q6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Speer4f1Q9D5Q6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Speer4f1Q9D5Q6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Speer4f1Q9D5Q6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Speer4f1Q9D5Q6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Speer4f1Q9D5Q6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Speer4f1Q9D5Q6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Speer4f1Q9D5Q6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Speer4f1Q9D5Q6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Speer4f1Q9D5Q6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.8 ms