Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3404Q9D506 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3404Q9D506 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm3404Q9D506 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3404Q9D506 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3404Q9D506 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3404Q9D506 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm3404Q9D506 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3404Q9D506 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3404Q9D506 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3404Q9D506 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3404Q9D506 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3404Q9D506 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3404Q9D506 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3404Q9D506 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3404Q9D506 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm3404Q9D506 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3404Q9D506 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3404Q9D506 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3404Q9D506 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3404Q9D506 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3404Q9D506 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3404Q9D506 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm3404Q9D506 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3404Q9D506 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3404Q9D506 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3404Q9D506 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3404Q9D506 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3404Q9D506 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3404Q9D506 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm3404Q9D506 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3404Q9D506 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3404Q9D506 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm3404Q9D506 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3404Q9D506 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3404Q9D506 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3404Q9D506 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm3404Q9D506 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3404Q9D506 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3404Q9D506 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3404Q9D506 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3404Q9D506 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3404Q9D506 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gm3404Q9D506 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm3404Q9D506 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3404Q9D506 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3404Q9D506 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3404Q9D506 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3404Q9D506 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3404Q9D506 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3404Q9D506 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3404Q9D506 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm3404Q9D506 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3404Q9D506 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3404Q9D506 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gm3404Q9D506 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gm3404Q9D506 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm3404Q9D506 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms