Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Y3

Rhox2a, Reproductive homeobox 2A, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2aQ9D4Y3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rhox2aQ9D4Y3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rhox2aQ9D4Y3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rhox2aQ9D4Y3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rhox2aQ9D4Y3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rhox2aQ9D4Y3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rhox2aQ9D4Y3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rhox2aQ9D4Y3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rhox2aQ9D4Y3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rhox2aQ9D4Y3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rhox2aQ9D4Y3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rhox2aQ9D4Y3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rhox2aQ9D4Y3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rhox2aQ9D4Y3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rhox2aQ9D4Y3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Rhox2aQ9D4Y3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rhox2aQ9D4Y3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rhox2aQ9D4Y3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rhox2aQ9D4Y3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rhox2aQ9D4Y3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rhox2aQ9D4Y3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rhox2aQ9D4Y3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rhox2aQ9D4Y3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rhox2aQ9D4Y3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rhox2aQ9D4Y3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rhox2aQ9D4Y3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rhox2aQ9D4Y3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rhox2aQ9D4Y3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rhox2aQ9D4Y3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rhox2aQ9D4Y3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rhox2aQ9D4Y3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Rhox2aQ9D4Y3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rhox2aQ9D4Y3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rhox2aQ9D4Y3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rhox2aQ9D4Y3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rhox2aQ9D4Y3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rhox2aQ9D4Y3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rhox2aQ9D4Y3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rhox2aQ9D4Y3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rhox2aQ9D4Y3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rhox2aQ9D4Y3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rhox2aQ9D4Y3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rhox2aQ9D4Y3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rhox2aQ9D4Y3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rhox2aQ9D4Y3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rhox2aQ9D4Y3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rhox2aQ9D4Y3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rhox2aQ9D4Y3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rhox2aQ9D4Y3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rhox2aQ9D4Y3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rhox2aQ9D4Y3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rhox2aQ9D4Y3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rhox2aQ9D4Y3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rhox2aQ9D4Y3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rhox2aQ9D4Y3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rhox2aQ9D4Y3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rhox2aQ9D4Y3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rhox2aQ9D4Y3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rhox2aQ9D4Y3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rhox2aQ9D4Y3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rhox2aQ9D4Y3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rhox2aQ9D4Y3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rhox2aQ9D4Y3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rhox2aQ9D4Y3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rhox2aQ9D4Y3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Rhox2aQ9D4Y3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rhox2aQ9D4Y3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rhox2aQ9D4Y3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rhox2aQ9D4Y3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rhox2aQ9D4Y3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Rhox2aQ9D4Y3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rhox2aQ9D4Y3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rhox2aQ9D4Y3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rhox2aQ9D4Y3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rhox2aQ9D4Y3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rhox2aQ9D4Y3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rhox2aQ9D4Y3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rhox2aQ9D4Y3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rhox2aQ9D4Y3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rhox2aQ9D4Y3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Rhox2aQ9D4Y3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rhox2aQ9D4Y3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rhox2aQ9D4Y3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rhox2aQ9D4Y3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rhox2aQ9D4Y3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rhox2aQ9D4Y3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rhox2aQ9D4Y3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rhox2aQ9D4Y3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rhox2aQ9D4Y3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rhox2aQ9D4Y3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rhox2aQ9D4Y3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rhox2aQ9D4Y3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rhox2aQ9D4Y3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rhox2aQ9D4Y3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Rhox2aQ9D4Y3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rhox2aQ9D4Y3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms