Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V7

Rabl3, Rab-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl3Q9D4V7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rabl3Q9D4V7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rabl3Q9D4V7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rabl3Q9D4V7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rabl3Q9D4V7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rabl3Q9D4V7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rabl3Q9D4V7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rabl3Q9D4V7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rabl3Q9D4V7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rabl3Q9D4V7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rabl3Q9D4V7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rabl3Q9D4V7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rabl3Q9D4V7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rabl3Q9D4V7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rabl3Q9D4V7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rabl3Q9D4V7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rabl3Q9D4V7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rabl3Q9D4V7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rabl3Q9D4V7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rabl3Q9D4V7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rabl3Q9D4V7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rabl3Q9D4V7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rabl3Q9D4V7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rabl3Q9D4V7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rabl3Q9D4V7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rabl3Q9D4V7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rabl3Q9D4V7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rabl3Q9D4V7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rabl3Q9D4V7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rabl3Q9D4V7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rabl3Q9D4V7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rabl3Q9D4V7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rabl3Q9D4V7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rabl3Q9D4V7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rabl3Q9D4V7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rabl3Q9D4V7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rabl3Q9D4V7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rabl3Q9D4V7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rabl3Q9D4V7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rabl3Q9D4V7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rabl3Q9D4V7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rabl3Q9D4V7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rabl3Q9D4V7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rabl3Q9D4V7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rabl3Q9D4V7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rabl3Q9D4V7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rabl3Q9D4V7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rabl3Q9D4V7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rabl3Q9D4V7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rabl3Q9D4V7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rabl3Q9D4V7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rabl3Q9D4V7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rabl3Q9D4V7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rabl3Q9D4V7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rabl3Q9D4V7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rabl3Q9D4V7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rabl3Q9D4V7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rabl3Q9D4V7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rabl3Q9D4V7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rabl3Q9D4V7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rabl3Q9D4V7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rabl3Q9D4V7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rabl3Q9D4V7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rabl3Q9D4V7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rabl3Q9D4V7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rabl3Q9D4V7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rabl3Q9D4V7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rabl3Q9D4V7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rabl3Q9D4V7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rabl3Q9D4V7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rabl3Q9D4V7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rabl3Q9D4V7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rabl3Q9D4V7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rabl3Q9D4V7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rabl3Q9D4V7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rabl3Q9D4V7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rabl3Q9D4V7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rabl3Q9D4V7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rabl3Q9D4V7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rabl3Q9D4V7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rabl3Q9D4V7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rabl3Q9D4V7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rabl3Q9D4V7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rabl3Q9D4V7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rabl3Q9D4V7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rabl3Q9D4V7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rabl3Q9D4V7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rabl3Q9D4V7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rabl3Q9D4V7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rabl3Q9D4V7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rabl3Q9D4V7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rabl3Q9D4V7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rabl3Q9D4V7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rabl3Q9D4V7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rabl3Q9D4V7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rabl3Q9D4V7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rabl3Q9D4V7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rabl3Q9D4V7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rabl3Q9D4V7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rabl3Q9D4V7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms