Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gcc1Q9D4H2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gcc1Q9D4H2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gcc1Q9D4H2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gcc1Q9D4H2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gcc1Q9D4H2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Gcc1Q9D4H2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gcc1Q9D4H2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gcc1Q9D4H2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gcc1Q9D4H2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gcc1Q9D4H2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gcc1Q9D4H2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gcc1Q9D4H2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Gcc1Q9D4H2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Gcc1Q9D4H2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gcc1Q9D4H2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gcc1Q9D4H2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gcc1Q9D4H2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gcc1Q9D4H2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gcc1Q9D4H2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gcc1Q9D4H2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gcc1Q9D4H2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gcc1Q9D4H2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gcc1Q9D4H2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gcc1Q9D4H2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gcc1Q9D4H2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gcc1Q9D4H2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gcc1Q9D4H2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gcc1Q9D4H2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gcc1Q9D4H2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gcc1Q9D4H2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gcc1Q9D4H2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gcc1Q9D4H2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gcc1Q9D4H2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gcc1Q9D4H2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Gcc1Q9D4H2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gcc1Q9D4H2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gcc1Q9D4H2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gcc1Q9D4H2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gcc1Q9D4H2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gcc1Q9D4H2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gcc1Q9D4H2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gcc1Q9D4H2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gcc1Q9D4H2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gcc1Q9D4H2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gcc1Q9D4H2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Gcc1Q9D4H2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gcc1Q9D4H2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gcc1Q9D4H2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gcc1Q9D4H2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gcc1Q9D4H2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Gcc1Q9D4H2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gcc1Q9D4H2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gcc1Q9D4H2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gcc1Q9D4H2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gcc1Q9D4H2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gcc1Q9D4H2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gcc1Q9D4H2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gcc1Q9D4H2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gcc1Q9D4H2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Gcc1Q9D4H2 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gcc1Q9D4H2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gcc1Q9D4H2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gcc1Q9D4H2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gcc1Q9D4H2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gcc1Q9D4H2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gcc1Q9D4H2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gcc1Q9D4H2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Gcc1Q9D4H2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gcc1Q9D4H2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gcc1Q9D4H2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gcc1Q9D4H2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gcc1Q9D4H2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gcc1Q9D4H2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gcc1Q9D4H2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gcc1Q9D4H2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gcc1Q9D4H2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gcc1Q9D4H2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gcc1Q9D4H2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gcc1Q9D4H2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gcc1Q9D4H2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gcc1Q9D4H2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gcc1Q9D4H2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gcc1Q9D4H2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gcc1Q9D4H2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gcc1Q9D4H2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gcc1Q9D4H2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gcc1Q9D4H2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gcc1Q9D4H2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gcc1Q9D4H2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gcc1Q9D4H2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gcc1Q9D4H2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gcc1Q9D4H2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gcc1Q9D4H2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Gcc1Q9D4H2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gcc1Q9D4H2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gcc1Q9D4H2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Gcc1Q9D4H2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gcc1Q9D4H2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gcc1Q9D4H2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms