Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rufy3Q9D394 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rufy3Q9D394 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rufy3Q9D394 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rufy3Q9D394 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rufy3Q9D394 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rufy3Q9D394 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rufy3Q9D394 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rufy3Q9D394 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rufy3Q9D394 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rufy3Q9D394 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rufy3Q9D394 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rufy3Q9D394 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rufy3Q9D394 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rufy3Q9D394 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rufy3Q9D394 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rufy3Q9D394 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rufy3Q9D394 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rufy3Q9D394 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rufy3Q9D394 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rufy3Q9D394 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rufy3Q9D394 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rufy3Q9D394 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rufy3Q9D394 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rufy3Q9D394 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rufy3Q9D394 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rufy3Q9D394 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rufy3Q9D394 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rufy3Q9D394 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rufy3Q9D394 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rufy3Q9D394 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rufy3Q9D394 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Rufy3Q9D394 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rufy3Q9D394 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rufy3Q9D394 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rufy3Q9D394 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rufy3Q9D394 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rufy3Q9D394 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rufy3Q9D394 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rufy3Q9D394 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Rufy3Q9D394 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Rufy3Q9D394 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Rufy3Q9D394 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rufy3Q9D394 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rufy3Q9D394 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rufy3Q9D394 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rufy3Q9D394 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rufy3Q9D394 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rufy3Q9D394 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rufy3Q9D394 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rufy3Q9D394 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rufy3Q9D394 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rufy3Q9D394 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rufy3Q9D394 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rufy3Q9D394 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rufy3Q9D394 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rufy3Q9D394 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rufy3Q9D394 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rufy3Q9D394 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rufy3Q9D394 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rufy3Q9D394 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rufy3Q9D394 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rufy3Q9D394 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rufy3Q9D394 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rufy3Q9D394 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Rufy3Q9D394 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rufy3Q9D394 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rufy3Q9D394 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rufy3Q9D394 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rufy3Q9D394 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rufy3Q9D394 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rufy3Q9D394 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rufy3Q9D394 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rufy3Q9D394 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rufy3Q9D394 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rufy3Q9D394 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rufy3Q9D394 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rufy3Q9D394 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rufy3Q9D394 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rufy3Q9D394 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rufy3Q9D394 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rufy3Q9D394 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rufy3Q9D394 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rufy3Q9D394 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rufy3Q9D394 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rufy3Q9D394 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rufy3Q9D394 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Rufy3Q9D394 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rufy3Q9D394 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rufy3Q9D394 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rufy3Q9D394 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rufy3Q9D394 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rufy3Q9D394 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rufy3Q9D394 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rufy3Q9D394 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rufy3Q9D394 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rufy3Q9D394 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rufy3Q9D394 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Rufy3Q9D394 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Rufy3Q9D394 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms