Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2N9

Vps33a, Vacuolar protein sorting-associated protein 33A, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33aQ9D2N9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps33aQ9D2N9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps33aQ9D2N9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps33aQ9D2N9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps33aQ9D2N9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vps33aQ9D2N9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vps33aQ9D2N9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps33aQ9D2N9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps33aQ9D2N9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps33aQ9D2N9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps33aQ9D2N9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps33aQ9D2N9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps33aQ9D2N9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps33aQ9D2N9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps33aQ9D2N9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps33aQ9D2N9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps33aQ9D2N9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps33aQ9D2N9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps33aQ9D2N9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps33aQ9D2N9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps33aQ9D2N9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps33aQ9D2N9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps33aQ9D2N9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps33aQ9D2N9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps33aQ9D2N9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps33aQ9D2N9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps33aQ9D2N9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps33aQ9D2N9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps33aQ9D2N9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps33aQ9D2N9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps33aQ9D2N9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps33aQ9D2N9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps33aQ9D2N9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps33aQ9D2N9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps33aQ9D2N9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps33aQ9D2N9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps33aQ9D2N9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps33aQ9D2N9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps33aQ9D2N9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps33aQ9D2N9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps33aQ9D2N9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps33aQ9D2N9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps33aQ9D2N9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps33aQ9D2N9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps33aQ9D2N9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps33aQ9D2N9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps33aQ9D2N9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Vps33aQ9D2N9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vps33aQ9D2N9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps33aQ9D2N9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps33aQ9D2N9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps33aQ9D2N9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps33aQ9D2N9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps33aQ9D2N9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps33aQ9D2N9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps33aQ9D2N9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps33aQ9D2N9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps33aQ9D2N9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps33aQ9D2N9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps33aQ9D2N9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps33aQ9D2N9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps33aQ9D2N9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps33aQ9D2N9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps33aQ9D2N9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps33aQ9D2N9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps33aQ9D2N9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps33aQ9D2N9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps33aQ9D2N9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps33aQ9D2N9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps33aQ9D2N9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps33aQ9D2N9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps33aQ9D2N9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps33aQ9D2N9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps33aQ9D2N9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps33aQ9D2N9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps33aQ9D2N9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps33aQ9D2N9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps33aQ9D2N9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps33aQ9D2N9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps33aQ9D2N9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps33aQ9D2N9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps33aQ9D2N9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps33aQ9D2N9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps33aQ9D2N9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Vps33aQ9D2N9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps33aQ9D2N9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Vps33aQ9D2N9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps33aQ9D2N9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps33aQ9D2N9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps33aQ9D2N9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps33aQ9D2N9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps33aQ9D2N9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps33aQ9D2N9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps33aQ9D2N9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps33aQ9D2N9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps33aQ9D2N9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps33aQ9D2N9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps33aQ9D2N9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps33aQ9D2N9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps33aQ9D2N9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms