Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J1

Necap2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necap2Q9D1J1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Necap2Q9D1J1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Necap2Q9D1J1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Necap2Q9D1J1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Necap2Q9D1J1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Necap2Q9D1J1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Necap2Q9D1J1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Necap2Q9D1J1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Necap2Q9D1J1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Necap2Q9D1J1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Necap2Q9D1J1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Necap2Q9D1J1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Necap2Q9D1J1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Necap2Q9D1J1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Necap2Q9D1J1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Necap2Q9D1J1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Necap2Q9D1J1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Necap2Q9D1J1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Necap2Q9D1J1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Necap2Q9D1J1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Necap2Q9D1J1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Necap2Q9D1J1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Necap2Q9D1J1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Necap2Q9D1J1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Necap2Q9D1J1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Necap2Q9D1J1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Necap2Q9D1J1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Necap2Q9D1J1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Necap2Q9D1J1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Necap2Q9D1J1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Necap2Q9D1J1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms