Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl53Q9D1H8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl53Q9D1H8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl53Q9D1H8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl53Q9D1H8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl53Q9D1H8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl53Q9D1H8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl53Q9D1H8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl53Q9D1H8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl53Q9D1H8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl53Q9D1H8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl53Q9D1H8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl53Q9D1H8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl53Q9D1H8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl53Q9D1H8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl53Q9D1H8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl53Q9D1H8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl53Q9D1H8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl53Q9D1H8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl53Q9D1H8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl53Q9D1H8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl53Q9D1H8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl53Q9D1H8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl53Q9D1H8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl53Q9D1H8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl53Q9D1H8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl53Q9D1H8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl53Q9D1H8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl53Q9D1H8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl53Q9D1H8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl53Q9D1H8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl53Q9D1H8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl53Q9D1H8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl53Q9D1H8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl53Q9D1H8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl53Q9D1H8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Mrpl53Q9D1H8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl53Q9D1H8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl53Q9D1H8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mrpl53Q9D1H8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl53Q9D1H8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mrpl53Q9D1H8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms