Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F1

Ndc80, Kinetochore protein NDC80 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndc80Q9D0F1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndc80Q9D0F1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndc80Q9D0F1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndc80Q9D0F1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndc80Q9D0F1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndc80Q9D0F1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndc80Q9D0F1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndc80Q9D0F1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndc80Q9D0F1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndc80Q9D0F1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndc80Q9D0F1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndc80Q9D0F1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ndc80Q9D0F1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ndc80Q9D0F1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ndc80Q9D0F1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ndc80Q9D0F1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ndc80Q9D0F1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ndc80Q9D0F1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ndc80Q9D0F1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ndc80Q9D0F1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ndc80Q9D0F1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ndc80Q9D0F1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ndc80Q9D0F1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ndc80Q9D0F1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ndc80Q9D0F1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ndc80Q9D0F1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ndc80Q9D0F1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ndc80Q9D0F1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ndc80Q9D0F1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ndc80Q9D0F1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ndc80Q9D0F1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ndc80Q9D0F1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ndc80Q9D0F1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ndc80Q9D0F1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ndc80Q9D0F1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ndc80Q9D0F1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ndc80Q9D0F1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ndc80Q9D0F1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ndc80Q9D0F1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ndc80Q9D0F1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ndc80Q9D0F1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ndc80Q9D0F1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ndc80Q9D0F1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ndc80Q9D0F1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ndc80Q9D0F1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ndc80Q9D0F1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ndc80Q9D0F1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ndc80Q9D0F1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ndc80Q9D0F1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ndc80Q9D0F1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ndc80Q9D0F1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ndc80Q9D0F1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ndc80Q9D0F1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ndc80Q9D0F1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ndc80Q9D0F1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndc80Q9D0F1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndc80Q9D0F1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndc80Q9D0F1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndc80Q9D0F1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndc80Q9D0F1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndc80Q9D0F1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndc80Q9D0F1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndc80Q9D0F1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms