Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW6

Rnf146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf146Q9CZW6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf146Q9CZW6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf146Q9CZW6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf146Q9CZW6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf146Q9CZW6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf146Q9CZW6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf146Q9CZW6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf146Q9CZW6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf146Q9CZW6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rnf146Q9CZW6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf146Q9CZW6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf146Q9CZW6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf146Q9CZW6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf146Q9CZW6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rnf146Q9CZW6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf146Q9CZW6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf146Q9CZW6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rnf146Q9CZW6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf146Q9CZW6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf146Q9CZW6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf146Q9CZW6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf146Q9CZW6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf146Q9CZW6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf146Q9CZW6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf146Q9CZW6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf146Q9CZW6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rnf146Q9CZW6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf146Q9CZW6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf146Q9CZW6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf146Q9CZW6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf146Q9CZW6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf146Q9CZW6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf146Q9CZW6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf146Q9CZW6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rnf146Q9CZW6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf146Q9CZW6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf146Q9CZW6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf146Q9CZW6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf146Q9CZW6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf146Q9CZW6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf146Q9CZW6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rnf146Q9CZW6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf146Q9CZW6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf146Q9CZW6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf146Q9CZW6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf146Q9CZW6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf146Q9CZW6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rnf146Q9CZW6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf146Q9CZW6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf146Q9CZW6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf146Q9CZW6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf146Q9CZW6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf146Q9CZW6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rnf146Q9CZW6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf146Q9CZW6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf146Q9CZW6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf146Q9CZW6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf146Q9CZW6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rnf146Q9CZW6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rnf146Q9CZW6 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf146Q9CZW6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf146Q9CZW6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf146Q9CZW6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf146Q9CZW6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf146Q9CZW6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rnf146Q9CZW6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf146Q9CZW6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf146Q9CZW6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf146Q9CZW6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf146Q9CZW6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf146Q9CZW6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf146Q9CZW6 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf146Q9CZW6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf146Q9CZW6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf146Q9CZW6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf146Q9CZW6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf146Q9CZW6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rnf146Q9CZW6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf146Q9CZW6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf146Q9CZW6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf146Q9CZW6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf146Q9CZW6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rnf146Q9CZW6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf146Q9CZW6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf146Q9CZW6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf146Q9CZW6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rnf146Q9CZW6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf146Q9CZW6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf146Q9CZW6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf146Q9CZW6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf146Q9CZW6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf146Q9CZW6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rnf146Q9CZW6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf146Q9CZW6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf146Q9CZW6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rnf146Q9CZW6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf146Q9CZW6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf146Q9CZW6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf146Q9CZW6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rnf146Q9CZW6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.3 ms