Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYR0

Ssbp1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp1Q9CYR0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp1Q9CYR0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp1Q9CYR0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp1Q9CYR0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ssbp1Q9CYR0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp1Q9CYR0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp1Q9CYR0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp1Q9CYR0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp1Q9CYR0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp1Q9CYR0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ssbp1Q9CYR0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp1Q9CYR0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp1Q9CYR0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp1Q9CYR0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp1Q9CYR0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp1Q9CYR0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp1Q9CYR0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp1Q9CYR0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ssbp1Q9CYR0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp1Q9CYR0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp1Q9CYR0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp1Q9CYR0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp1Q9CYR0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp1Q9CYR0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp1Q9CYR0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp1Q9CYR0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ssbp1Q9CYR0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp1Q9CYR0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp1Q9CYR0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp1Q9CYR0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp1Q9CYR0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp1Q9CYR0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ssbp1Q9CYR0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ssbp1Q9CYR0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssbp1Q9CYR0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms