Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mis12Q9CY25 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mis12Q9CY25 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mis12Q9CY25 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mis12Q9CY25 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mis12Q9CY25 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mis12Q9CY25 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mis12Q9CY25 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mis12Q9CY25 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mis12Q9CY25 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Mis12Q9CY25 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mis12Q9CY25 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mis12Q9CY25 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mis12Q9CY25 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mis12Q9CY25 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mis12Q9CY25 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mis12Q9CY25 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mis12Q9CY25 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mis12Q9CY25 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mis12Q9CY25 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mis12Q9CY25 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mis12Q9CY25 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mis12Q9CY25 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mis12Q9CY25 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mis12Q9CY25 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mis12Q9CY25 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mis12Q9CY25 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mis12Q9CY25 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mis12Q9CY25 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mis12Q9CY25 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mis12Q9CY25 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mis12Q9CY25 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Mis12Q9CY25 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mis12Q9CY25 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mis12Q9CY25 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mis12Q9CY25 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Mis12Q9CY25 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mis12Q9CY25 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mis12Q9CY25 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mis12Q9CY25 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mis12Q9CY25 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mis12Q9CY25 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mis12Q9CY25 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mis12Q9CY25 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mis12Q9CY25 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Mis12Q9CY25 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mis12Q9CY25 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mis12Q9CY25 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mis12Q9CY25 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mis12Q9CY25 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mis12Q9CY25 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mis12Q9CY25 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mis12Q9CY25 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mis12Q9CY25 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Mis12Q9CY25 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mis12Q9CY25 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mis12Q9CY25 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mis12Q9CY25 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Mis12Q9CY25 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mis12Q9CY25 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mis12Q9CY25 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mis12Q9CY25 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mis12Q9CY25 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mis12Q9CY25 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Mis12Q9CY25 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mis12Q9CY25 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mis12Q9CY25 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Mis12Q9CY25 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mis12Q9CY25 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mis12Q9CY25 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Mis12Q9CY25 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Mis12Q9CY25 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mis12Q9CY25 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mis12Q9CY25 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mis12Q9CY25 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mis12Q9CY25 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mis12Q9CY25 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mis12Q9CY25 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mis12Q9CY25 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mis12Q9CY25 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mis12Q9CY25 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mis12Q9CY25 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mis12Q9CY25 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mis12Q9CY25 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mis12Q9CY25 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mis12Q9CY25 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mis12Q9CY25 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mis12Q9CY25 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Mis12Q9CY25 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mis12Q9CY25 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Mis12Q9CY25 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mis12Q9CY25 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mis12Q9CY25 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mis12Q9CY25 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mis12Q9CY25 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mis12Q9CY25 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mis12Q9CY25 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mis12Q9CY25 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mis12Q9CY25 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mis12Q9CY25 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms