Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sgo1Q9CXH7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sgo1Q9CXH7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sgo1Q9CXH7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sgo1Q9CXH7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sgo1Q9CXH7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sgo1Q9CXH7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sgo1Q9CXH7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sgo1Q9CXH7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sgo1Q9CXH7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sgo1Q9CXH7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sgo1Q9CXH7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sgo1Q9CXH7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sgo1Q9CXH7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sgo1Q9CXH7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sgo1Q9CXH7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sgo1Q9CXH7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sgo1Q9CXH7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sgo1Q9CXH7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sgo1Q9CXH7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sgo1Q9CXH7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sgo1Q9CXH7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sgo1Q9CXH7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sgo1Q9CXH7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sgo1Q9CXH7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sgo1Q9CXH7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sgo1Q9CXH7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sgo1Q9CXH7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sgo1Q9CXH7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sgo1Q9CXH7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sgo1Q9CXH7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sgo1Q9CXH7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sgo1Q9CXH7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sgo1Q9CXH7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sgo1Q9CXH7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Sgo1Q9CXH7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sgo1Q9CXH7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sgo1Q9CXH7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sgo1Q9CXH7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sgo1Q9CXH7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sgo1Q9CXH7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sgo1Q9CXH7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sgo1Q9CXH7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sgo1Q9CXH7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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