Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR53

Nmb, Neuromedin-B, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbQ9CR53 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NmbQ9CR53 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NmbQ9CR53 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NmbQ9CR53 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NmbQ9CR53 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NmbQ9CR53 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NmbQ9CR53 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NmbQ9CR53 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NmbQ9CR53 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NmbQ9CR53 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NmbQ9CR53 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NmbQ9CR53 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NmbQ9CR53 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NmbQ9CR53 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NmbQ9CR53 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NmbQ9CR53 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NmbQ9CR53 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NmbQ9CR53 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NmbQ9CR53 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NmbQ9CR53 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NmbQ9CR53 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NmbQ9CR53 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NmbQ9CR53 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NmbQ9CR53 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NmbQ9CR53 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NmbQ9CR53 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NmbQ9CR53 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NmbQ9CR53 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NmbQ9CR53 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NmbQ9CR53 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NmbQ9CR53 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NmbQ9CR53 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NmbQ9CR53 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NmbQ9CR53 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NmbQ9CR53 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NmbQ9CR53 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NmbQ9CR53 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NmbQ9CR53 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NmbQ9CR53 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NmbQ9CR53 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NmbQ9CR53 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NmbQ9CR53 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NmbQ9CR53 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NmbQ9CR53 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NmbQ9CR53 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NmbQ9CR53 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NmbQ9CR53 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NmbQ9CR53 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NmbQ9CR53 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NmbQ9CR53 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NmbQ9CR53 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NmbQ9CR53 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NmbQ9CR53 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NmbQ9CR53 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NmbQ9CR53 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NmbQ9CR53 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NmbQ9CR53 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NmbQ9CR53 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NmbQ9CR53 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NmbQ9CR53 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NmbQ9CR53 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NmbQ9CR53 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NmbQ9CR53 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NmbQ9CR53 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NmbQ9CR53 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NmbQ9CR53 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NmbQ9CR53 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NmbQ9CR53 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NmbQ9CR53 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NmbQ9CR53 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NmbQ9CR53 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NmbQ9CR53 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NmbQ9CR53 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NmbQ9CR53 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NmbQ9CR53 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NmbQ9CR53 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NmbQ9CR53 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NmbQ9CR53 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NmbQ9CR53 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NmbQ9CR53 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NmbQ9CR53 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NmbQ9CR53 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NmbQ9CR53 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NmbQ9CR53 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NmbQ9CR53 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NmbQ9CR53 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NmbQ9CR53 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NmbQ9CR53 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NmbQ9CR53 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NmbQ9CR53 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms