Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR36

Gkn1, Gastrokine-1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn1Q9CR36 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gkn1Q9CR36 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gkn1Q9CR36 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gkn1Q9CR36 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gkn1Q9CR36 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gkn1Q9CR36 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gkn1Q9CR36 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gkn1Q9CR36 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gkn1Q9CR36 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gkn1Q9CR36 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gkn1Q9CR36 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gkn1Q9CR36 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gkn1Q9CR36 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gkn1Q9CR36 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gkn1Q9CR36 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gkn1Q9CR36 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gkn1Q9CR36 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gkn1Q9CR36 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gkn1Q9CR36 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gkn1Q9CR36 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gkn1Q9CR36 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gkn1Q9CR36 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gkn1Q9CR36 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gkn1Q9CR36 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gkn1Q9CR36 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gkn1Q9CR36 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gkn1Q9CR36 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gkn1Q9CR36 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gkn1Q9CR36 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gkn1Q9CR36 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gkn1Q9CR36 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gkn1Q9CR36 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gkn1Q9CR36 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gkn1Q9CR36 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gkn1Q9CR36 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gkn1Q9CR36 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gkn1Q9CR36 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gkn1Q9CR36 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gkn1Q9CR36 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gkn1Q9CR36 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gkn1Q9CR36 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gkn1Q9CR36 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gkn1Q9CR36 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gkn1Q9CR36 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gkn1Q9CR36 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms