Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
4931417E11RikQ9CR05 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
4931417E11RikQ9CR05 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
4931417E11RikQ9CR05 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
4931417E11RikQ9CR05 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
4931417E11RikQ9CR05 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4931417E11RikQ9CR05 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4931417E11RikQ9CR05 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
4931417E11RikQ9CR05 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4931417E11RikQ9CR05 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4931417E11RikQ9CR05 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
4931417E11RikQ9CR05 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
4931417E11RikQ9CR05 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931417E11RikQ9CR05 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931417E11RikQ9CR05 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931417E11RikQ9CR05 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931417E11RikQ9CR05 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931417E11RikQ9CR05 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931417E11RikQ9CR05 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931417E11RikQ9CR05 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931417E11RikQ9CR05 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
4931417E11RikQ9CR05 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931417E11RikQ9CR05 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931417E11RikQ9CR05 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931417E11RikQ9CR05 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931417E11RikQ9CR05 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931417E11RikQ9CR05 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
4931417E11RikQ9CR05 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4931417E11RikQ9CR05 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4931417E11RikQ9CR05 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4931417E11RikQ9CR05 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4931417E11RikQ9CR05 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4931417E11RikQ9CR05 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4931417E11RikQ9CR05 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4931417E11RikQ9CR05 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
4931417E11RikQ9CR05 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4931417E11RikQ9CR05 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
4931417E11RikQ9CR05 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931417E11RikQ9CR05 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931417E11RikQ9CR05 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931417E11RikQ9CR05 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931417E11RikQ9CR05 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931417E11RikQ9CR05 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931417E11RikQ9CR05 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4931417E11RikQ9CR05 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4931417E11RikQ9CR05 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4931417E11RikQ9CR05 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4931417E11RikQ9CR05 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4931417E11RikQ9CR05 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4931417E11RikQ9CR05 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4931417E11RikQ9CR05 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4931417E11RikQ9CR05 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4931417E11RikQ9CR05 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4931417E11RikQ9CR05 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4931417E11RikQ9CR05 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4931417E11RikQ9CR05 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4931417E11RikQ9CR05 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4931417E11RikQ9CR05 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4931417E11RikQ9CR05 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4931417E11RikQ9CR05 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4931417E11RikQ9CR05 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4931417E11RikQ9CR05 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4931417E11RikQ9CR05 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4931417E11RikQ9CR05 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
4931417E11RikQ9CR05 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4931417E11RikQ9CR05 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4931417E11RikQ9CR05 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4931417E11RikQ9CR05 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4931417E11RikQ9CR05 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4931417E11RikQ9CR05 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4931417E11RikQ9CR05 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4931417E11RikQ9CR05 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4931417E11RikQ9CR05 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4931417E11RikQ9CR05 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4931417E11RikQ9CR05 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4931417E11RikQ9CR05 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4931417E11RikQ9CR05 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4931417E11RikQ9CR05 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4931417E11RikQ9CR05 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4931417E11RikQ9CR05 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4931417E11RikQ9CR05 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4931417E11RikQ9CR05 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4931417E11RikQ9CR05 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4931417E11RikQ9CR05 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4931417E11RikQ9CR05 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4931417E11RikQ9CR05 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4931417E11RikQ9CR05 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4931417E11RikQ9CR05 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4931417E11RikQ9CR05 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4931417E11RikQ9CR05 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4931417E11RikQ9CR05 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4931417E11RikQ9CR05 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4931417E11RikQ9CR05 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
4931417E11RikQ9CR05 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
4931417E11RikQ9CR05 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
4931417E11RikQ9CR05 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
4931417E11RikQ9CR05 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
4931417E11RikQ9CR05 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4931417E11RikQ9CR05 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
4931417E11RikQ9CR05 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms