Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PompQ9CQT5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PompQ9CQT5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PompQ9CQT5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PompQ9CQT5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PompQ9CQT5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PompQ9CQT5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PompQ9CQT5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PompQ9CQT5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PompQ9CQT5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PompQ9CQT5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PompQ9CQT5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PompQ9CQT5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PompQ9CQT5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PompQ9CQT5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PompQ9CQT5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PompQ9CQT5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PompQ9CQT5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PompQ9CQT5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PompQ9CQT5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PompQ9CQT5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PompQ9CQT5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PompQ9CQT5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PompQ9CQT5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PompQ9CQT5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PompQ9CQT5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PompQ9CQT5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PompQ9CQT5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PompQ9CQT5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PompQ9CQT5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PompQ9CQT5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PompQ9CQT5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PompQ9CQT5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PompQ9CQT5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PompQ9CQT5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PompQ9CQT5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PompQ9CQT5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PompQ9CQT5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PompQ9CQT5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PompQ9CQT5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PompQ9CQT5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PompQ9CQT5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PompQ9CQT5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PompQ9CQT5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PompQ9CQT5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PompQ9CQT5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PompQ9CQT5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PompQ9CQT5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PompQ9CQT5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PompQ9CQT5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PompQ9CQT5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PompQ9CQT5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms