Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Q9CQF4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9CQF4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9CQF4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9CQF4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9CQF4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9CQF4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Q9CQF4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9CQF4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9CQF4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9CQF4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9CQF4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Q9CQF4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Q9CQF4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9CQF4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9CQF4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9CQF4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9CQF4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9CQF4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9CQF4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9CQF4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Q9CQF4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9CQF4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9CQF4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9CQF4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9CQF4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9CQF4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9CQF4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9CQF4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9CQF4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9CQF4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9CQF4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9CQF4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9CQF4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9CQF4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9CQF4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9CQF4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9CQF4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9CQF4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9CQF4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9CQF4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9CQF4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9CQF4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9CQF4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9CQF4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9CQF4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9CQF4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9CQF4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9CQF4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9CQF4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9CQF4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9CQF4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9CQF4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9CQF4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9CQF4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9CQF4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9CQF4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9CQF4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9CQF4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CQF4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CQF4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CQF4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CQF4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CQF4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CQF4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CQF4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CQF4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CQF4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CQF4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CQF4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CQF4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9CQF4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9CQF4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9CQF4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9CQF4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9CQF4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9CQF4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9CQF4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9CQF4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9CQF4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9CQF4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9CQF4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9CQF4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9CQF4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Q9CQF4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9CQF4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9CQF4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9CQF4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9CQF4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9CQF4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Q9CQF4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9CQF4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Q9CQF4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9CQF4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9CQF4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9CQF4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9CQF4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9CQF4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9CQF4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Q9CQF4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms