Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
StambpQ9CQ26 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
StambpQ9CQ26 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
StambpQ9CQ26 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
StambpQ9CQ26 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
StambpQ9CQ26 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
StambpQ9CQ26 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
StambpQ9CQ26 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
StambpQ9CQ26 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
StambpQ9CQ26 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
StambpQ9CQ26 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
StambpQ9CQ26 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
StambpQ9CQ26 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
StambpQ9CQ26 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
StambpQ9CQ26 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
StambpQ9CQ26 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
StambpQ9CQ26 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
StambpQ9CQ26 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
StambpQ9CQ26 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
StambpQ9CQ26 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
StambpQ9CQ26 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
StambpQ9CQ26 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
StambpQ9CQ26 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
StambpQ9CQ26 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
StambpQ9CQ26 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
StambpQ9CQ26 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
StambpQ9CQ26 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
StambpQ9CQ26 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
StambpQ9CQ26 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
StambpQ9CQ26 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
StambpQ9CQ26 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
StambpQ9CQ26 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
StambpQ9CQ26 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
StambpQ9CQ26 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
StambpQ9CQ26 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
StambpQ9CQ26 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
StambpQ9CQ26 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
StambpQ9CQ26 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
StambpQ9CQ26 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
StambpQ9CQ26 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
StambpQ9CQ26 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
StambpQ9CQ26 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
StambpQ9CQ26 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
StambpQ9CQ26 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
StambpQ9CQ26 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
StambpQ9CQ26 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
StambpQ9CQ26 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
StambpQ9CQ26 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
StambpQ9CQ26 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
StambpQ9CQ26 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
StambpQ9CQ26 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
StambpQ9CQ26 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
StambpQ9CQ26 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
StambpQ9CQ26 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
StambpQ9CQ26 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
StambpQ9CQ26 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
StambpQ9CQ26 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
StambpQ9CQ26 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
StambpQ9CQ26 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
StambpQ9CQ26 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
StambpQ9CQ26 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
StambpQ9CQ26 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
StambpQ9CQ26 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
StambpQ9CQ26 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
StambpQ9CQ26 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
StambpQ9CQ26 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
StambpQ9CQ26 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
StambpQ9CQ26 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
StambpQ9CQ26 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
StambpQ9CQ26 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
StambpQ9CQ26 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
StambpQ9CQ26 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
StambpQ9CQ26 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
StambpQ9CQ26 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
StambpQ9CQ26 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
StambpQ9CQ26 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
StambpQ9CQ26 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
StambpQ9CQ26 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
StambpQ9CQ26 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
StambpQ9CQ26 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
StambpQ9CQ26 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
StambpQ9CQ26 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
StambpQ9CQ26 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
StambpQ9CQ26 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
StambpQ9CQ26 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
StambpQ9CQ26 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.4 ms