Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Atg3Q9CPX6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Atg3Q9CPX6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atg3Q9CPX6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atg3Q9CPX6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atg3Q9CPX6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atg3Q9CPX6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atg3Q9CPX6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atg3Q9CPX6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atg3Q9CPX6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atg3Q9CPX6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atg3Q9CPX6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atg3Q9CPX6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atg3Q9CPX6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atg3Q9CPX6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atg3Q9CPX6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atg3Q9CPX6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atg3Q9CPX6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atg3Q9CPX6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Atg3Q9CPX6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atg3Q9CPX6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atg3Q9CPX6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atg3Q9CPX6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atg3Q9CPX6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atg3Q9CPX6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atg3Q9CPX6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atg3Q9CPX6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atg3Q9CPX6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atg3Q9CPX6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atg3Q9CPX6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atg3Q9CPX6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atg3Q9CPX6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Atg3Q9CPX6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Atg3Q9CPX6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atg3Q9CPX6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atg3Q9CPX6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atg3Q9CPX6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atg3Q9CPX6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atg3Q9CPX6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atg3Q9CPX6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atg3Q9CPX6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atg3Q9CPX6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atg3Q9CPX6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atg3Q9CPX6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atg3Q9CPX6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atg3Q9CPX6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atg3Q9CPX6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atg3Q9CPX6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atg3Q9CPX6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atg3Q9CPX6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atg3Q9CPX6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atg3Q9CPX6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atg3Q9CPX6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Atg3Q9CPX6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atg3Q9CPX6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Atg3Q9CPX6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atg3Q9CPX6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atg3Q9CPX6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atg3Q9CPX6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atg3Q9CPX6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Atg3Q9CPX6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Atg3Q9CPX6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atg3Q9CPX6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Atg3Q9CPX6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Atg3Q9CPX6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atg3Q9CPX6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Atg3Q9CPX6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atg3Q9CPX6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atg3Q9CPX6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atg3Q9CPX6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atg3Q9CPX6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atg3Q9CPX6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Atg3Q9CPX6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Atg3Q9CPX6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Atg3Q9CPX6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atg3Q9CPX6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atg3Q9CPX6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Atg3Q9CPX6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atg3Q9CPX6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Atg3Q9CPX6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atg3Q9CPX6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atg3Q9CPX6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atg3Q9CPX6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atg3Q9CPX6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atg3Q9CPX6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Atg3Q9CPX6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Atg3Q9CPX6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Atg3Q9CPX6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Atg3Q9CPX6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atg3Q9CPX6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atg3Q9CPX6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atg3Q9CPX6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Atg3Q9CPX6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Atg3Q9CPX6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Atg3Q9CPX6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Atg3Q9CPX6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atg3Q9CPX6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atg3Q9CPX6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atg3Q9CPX6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Atg3Q9CPX6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms